More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3531 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
165 aa  326  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  69.39 
 
 
173 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  63.27 
 
 
157 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  63.27 
 
 
157 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  67.57 
 
 
158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  64.14 
 
 
157 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  61.39 
 
 
160 aa  177  8e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  59.86 
 
 
163 aa  174  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  42.04 
 
 
176 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 
359 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  44 
 
 
359 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  40.25 
 
 
173 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  44.97 
 
 
170 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  41.77 
 
 
182 aa  104  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 
168 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 
171 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  42.04 
 
 
170 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 
171 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 
171 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  41.25 
 
 
171 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 
171 aa  100  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  40.37 
 
 
170 aa  101  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  45.38 
 
 
178 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 
170 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 
170 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  42.14 
 
 
170 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  41.51 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
170 aa  99.8  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  41.13 
 
 
165 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  33.77 
 
 
154 aa  97.4  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  41.72 
 
 
358 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.33 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  43.41 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  40.46 
 
 
182 aa  95.1  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
154 aa  94.4  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1081  lipoprotein signal peptidase  39.58 
 
 
150 aa  94  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
169 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  42.03 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
169 aa  92.8  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  40 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  39.73 
 
 
165 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  34.23 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
155 aa  91.3  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  40.26 
 
 
158 aa  90.9  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  37.34 
 
 
180 aa  90.5  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  40.26 
 
 
364 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 
178 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  37.8 
 
 
168 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10890  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280945  unclonable  0.00000000228732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  39.49 
 
 
169 aa  87.8  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  36.88 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 
357 aa  87.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 
174 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0496  lipoprotein signal peptidase  37.18 
 
 
172 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0268765  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.42 
 
 
358 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  38.69 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  42.14 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 
164 aa  85.1  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  34.64 
 
 
178 aa  84.7  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 
160 aa  84.7  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1860  signal peptidase II  36.18 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  39.44 
 
 
154 aa  84.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  38.57 
 
 
164 aa  84.3  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  33.99 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  40.43 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  43.26 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  35.19 
 
 
166 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  46.36 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  38.73 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  31.71 
 
 
235 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  35.48 
 
 
169 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0553  lipoprotein signal peptidase  39.26 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0422697  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
152 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  32.69 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  32.89 
 
 
202 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0921  lipoprotein signal peptidase  33.8 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000390697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  34.84 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.41 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  39.57 
 
 
170 aa  80.5  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  35.51 
 
 
160 aa  80.5  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2364  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1835  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.672257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  33.1 
 
 
168 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  32.91 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  40.41 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  36.13 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>