More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0146 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0146  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 161 aa  310  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07781  lipoprotein signal peptidase  98.1 
 
 		 178 aa  298  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.246414  normal  0.0597023 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3531  lipoprotein signal peptidase  46.92 
 
 		 165 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16531  lipoprotein signal peptidase  41.91 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.710647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2328  lipoprotein signal peptidase  42.97 
 
 		 157 aa  103  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2475  lipoprotein signal peptidase  39.16 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  40.58 
 
 		 154 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1211  lipoprotein signal peptidase  45.89 
 
 		 163 aa  97.4  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1726  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0885  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 		 152 aa  94.7  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0111972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  43.92 
 
 		 176 aa  94.4  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10211  putative lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.148717  normal  0.209845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4193  lipoprotein signal peptidase  43.22 
 
 		 173 aa  92.8  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  32.73 
 
 		 358 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1258  lipoprotein signal peptidase  49.65 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1605  lipoprotein signal peptidase  44.09 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0351061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  41.45 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  35.37 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09461  lipoprotein signal peptidase  44.53 
 
 		 151 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.268315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  41.73 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 		 166 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 171 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  37.76 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  35.76 
 
 		 167 aa  87  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  38.78 
 
 		 182 aa  86.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 154 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  36.24 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  43.17 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4973  lipoprotein signal peptidase  38.03 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  36.11 
 
 		 170 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 		 171 aa  84.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  35.17 
 
 		 169 aa  84.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3230  lipoprotein signal peptidase  38.36 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  35.62 
 
 		 154 aa  84  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  84  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  38.85 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1280  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1255  lipoprotein signal peptidase  34.93 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.737429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  34.81 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0142  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0139  lipoprotein signal peptidase  32 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000441491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  35.86 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  37.75 
 
 		 170 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  33.56 
 
 		 359 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  33.56 
 
 		 359 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  36.73 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  39.87 
 
 		 170 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1015  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 154 aa  80.5  0.000000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000214304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  34.69 
 
 		 168 aa  80.5  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09981  lipoprotein signal peptidase  42.76 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  32.14 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0868  signal peptidase II  39.37 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  35.97 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0555  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.803857  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0710  lipoprotein signal peptidase  37.93 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108511 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0928  lipoprotein signal peptidase  36.5 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  34.46 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  32.41 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0853  signal peptidase II  38.81 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  33.55 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  32.39 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0762  lipoprotein signal peptidase  38.13 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  34.75 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  33.1 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  33.11 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  37.24 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  31.14 
 
 		 358 aa  77.8  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  32.19 
 
 		 172 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0509  lipoprotein signal peptidase  36.36 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  35.25 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  36.65 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  31.18 
 
 		 170 aa  77  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>