85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0228 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0228  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 		 787 aa  1603    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.433927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3059  putative Chase2 sensor protein  35.79 
 
 		 781 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.321518 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  45.36 
 
 		 1161 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  45.36 
 
 		 1161 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  43.7 
 
 		 1164 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3607  putative Chase2 sensor protein  42.12 
 
 		 902 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2507  putative Chase2 sensor protein  42.12 
 
 		 902 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.476468  normal  0.563168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  40.49 
 
 		 1163 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  41.08 
 
 		 2077 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  40.62 
 
 		 1177 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  40.93 
 
 		 1176 aa  273  7e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  42.05 
 
 		 1914 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  38.07 
 
 		 1932 aa  263  6.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  40.97 
 
 		 1477 aa  260  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4983  WD-40 repeat-containing protein  41.18 
 
 		 891 aa  260  9e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.709938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 		 1908 aa  258  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  38.9 
 
 		 1367 aa  258  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  38.42 
 
 		 1190 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  35.81 
 
 		 1209 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5743  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 		 335 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3878  sensor protein  35.78 
 
 		 782 aa  228  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00432264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0382  putative Chase2 sensor protein  34.79 
 
 		 783 aa  211  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4764  Serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  33.92 
 
 		 746 aa  208  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.272035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.93 
 
 		 678 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1855  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  33.91 
 
 		 872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.311227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  33.91 
 
 		 872 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  34.61 
 
 		 643 aa  199  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.48 
 
 		 717 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.446547  normal  0.266824 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32.34 
 
 		 1214 aa  191  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1813  WD repeat-containing protein  32.82 
 
 		 376 aa  184  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0550116  hitchhiker  0.000537026 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1893  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with Chase sensor  34.52 
 
 		 865 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64169e-22 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1758  diguanylate cyclase with Chase2 sensor  30.6 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.03 
 
 		 757 aa  171  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0638  diguanylate cyclase  31.59 
 
 		 737 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 		 1304 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2402  sensor protein  32.71 
 
 		 619 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532539  hitchhiker  0.0000375596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  31 
 
 		 1048 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2806  sensor protein  29.78 
 
 		 633 aa  162  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682487  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  26.63 
 
 		 744 aa  157  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 664 aa  154  7e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4135  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 922 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000370631  normal  0.0140414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4619  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.71 
 
 		 841 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0311461 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5483  CHASE2 domain protein  29.97 
 
 		 696 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0712134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.15 
 
 		 935 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 		 945 aa  122  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  29.01 
 
 		 735 aa  117  7.999999999999999e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5644  putative Chase2 sensor protein  24.77 
 
 		 686 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0408867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1847  hypothetical protein  27.87 
 
 		 870 aa  84  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.277811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4022  hypothetical protein  26.43 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.864107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  24.21 
 
 		 500 aa  79  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1353  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 864 aa  76.6  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  25.18 
 
 		 645 aa  74.7  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 702 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2972  hypothetical protein  24.3 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.44 
 
 		 611 aa  64.3  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.38 
 
 		 597 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3967  hypothetical protein  22.03 
 
 		 446 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1168  TIR protein  22.47 
 
 		 520 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1328  diguanylate cyclase  21.39 
 
 		 648 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5742  hypothetical protein  24.24 
 
 		 470 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1445  hypothetical protein  60.53 
 
 		 42 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0474  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 759 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.453015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  21.25 
 
 		 613 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.42 
 
 		 829 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.583983  hitchhiker  0.00918197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  20.74 
 
 		 729 aa  48.9  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4407  hypothetical protein  24.54 
 
 		 475 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684073 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 754 aa  47.8  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1625  hypothetical protein  21.28 
 
 		 466 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.236851 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1843  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.562935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2636  sensor histidine kinase  33.02 
 
 		 759 aa  47.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1659  Chase sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 828 aa  47.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0485776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0924  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1457  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0425  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1666  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672693  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1688  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0738  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 797 aa  47  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.85 
 
 		 758 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.856998  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  22.48 
 
 		 547 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4264  Toll-interleukin receptor  22.26 
 
 		 627 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3060  hypothetical protein  24.09 
 
 		 405 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  23.38 
 
 		 721 aa  45.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  38.81 
 
 		 614 aa  45.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4253  serine/threonine protein kinase  23.32 
 
 		 662 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.0204039 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>