More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2389 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2389  integrase family protein  100 
 
 		 345 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000168042  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3221  integrase family protein  47.98 
 
 		 337 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  hitchhiker  0.000000474252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1730  integrase family protein  54.69 
 
 		 317 aa  279  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4067  integrase/recombinase  51.04 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.130649  normal  0.280594 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0012  Phage integrase  42.02 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0645  integrase family protein  42.68 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000112195  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  40.89 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4229  phage integrase family protein  41.75 
 
 		 329 aa  215  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5582  integrase family protein  39.57 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4618  integrase family protein  40.62 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  40.37 
 
 		 325 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4462  integrase family protein  40.31 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  40.32 
 
 		 316 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  39.06 
 
 		 322 aa  196  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  34.78 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2794  integrase family protein  35.94 
 
 		 304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.160655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2966  site-specific recombinase, phage integrase family  32.74 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2751  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  33.75 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74292  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2840  Phage integrase  34.08 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2848  phage integrase family protein  35.62 
 
 		 304 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2939  integrase family protein  35.94 
 
 		 304 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2841  phage integrase family site specific recombinase  37.78 
 
 		 292 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.424466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  28.43 
 
 		 309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  29.84 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3218  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000104017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  27.22 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0730  phage integrase  25.96 
 
 		 305 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  35.96 
 
 		 305 aa  97.8  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  35.19 
 
 		 290 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  36.48 
 
 		 321 aa  90.9  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0872  integrase family protein  37.43 
 
 		 316 aa  90.1  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  32.9 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  37.09 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  29.58 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  36.26 
 
 		 308 aa  87  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  39.26 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  36.09 
 
 		 294 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1209  phage integrase family site specific recombinase  30.31 
 
 		 305 aa  85.9  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.764611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  36.24 
 
 		 309 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  31.51 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  38.36 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  29.36 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5631  integrase/recombinase  33.33 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000106041 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  33.72 
 
 		 295 aa  82.4  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  34.25 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  34.73 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.1 
 
 		 355 aa  82.4  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  30.1 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  31.02 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  36.14 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  36.75 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  32.49 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1146  tyrosine recombinase XerD  31.82 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  35.75 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  31.97 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2012  Phage integrase  36 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  36.67 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  28.99 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  35.22 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  34.32 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  33.47 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  35.95 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  36.88 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  31.95 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  31.95 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  37.34 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  32.35 
 
 		 296 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  34.62 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  37.58 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  37.75 
 
 		 336 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.89 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  32.6 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  36.13 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  29.27 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  30.32 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  34.7 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.05 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  34.81 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  34.41 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  27.04 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  35.1 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  29.34 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  34.09 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.72 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  34.39 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  27.1 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  34.36 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>