136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1032 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1032  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 388 aa  759    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1949  Spermidine/putrescine-binding periplasmic protein-like protein  46.86 
 
 		 443 aa  316  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3377  extracellular solute-binding protein family 1  39.12 
 
 		 414 aa  232  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0107966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3216  extracellular solute-binding protein  33.24 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.018285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3423  extracellular solute-binding protein family 1  34.82 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3723  extracellular solute-binding protein family 1  33.75 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415779  normal  0.44187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1048  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357098  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3622  extracellular solute-binding protein family 1  33.74 
 
 		 402 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.360569 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2788  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2417  extracellular solute-binding protein family 1  31.7 
 
 		 386 aa  161  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1486  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  30.89 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0980554 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2045  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.18 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.600032  hitchhiker  0.000000000000249454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01397  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  33.23 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2206  extracellular solute-binding protein family 1  33.23 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.313197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1619  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.91 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01408  hypothetical protein  33.23 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1091  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1524  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.91 
 
 		 381 aa  159  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2187  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227535  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2219  extracellular solute-binding protein  32.59 
 
 		 381 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0148  extracellular solute-binding protein family 1  33.12 
 
 		 389 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.934394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1734  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  32.91 
 
 		 381 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000404923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4132  extracellular solute-binding protein  29.89 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3646  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4236  extracellular solute-binding protein  30.57 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2128  extracellular solute-binding protein  30.59 
 
 		 381 aa  153  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.205497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3308  extracellular solute-binding protein  30.67 
 
 		 383 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.033715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2444  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 401 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.512848  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1540  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713242  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3076  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 351 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0574821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4157  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.194913  normal  0.672619 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1360  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  23.41 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0349752 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5429  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  0.485743 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2406  putrescine-binding periplasmic protein precursor  23.33 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  hitchhiker  0.00509094 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6036  extracellular solute-binding protein family 1  23.4 
 
 		 358 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.62779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3926  extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 374 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.808306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1341  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1703  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 398 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04220  putative binding protein component of ABC transporter  31.62 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3878  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4491  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5813  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 376 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4390  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 374 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243685  normal  0.0624884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3242  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 340 aa  53.5  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  23.37 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2575  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.941635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4388  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.926126  normal  0.244304 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5285  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  20.65 
 
 		 360 aa  50.8  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.416451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  24.82 
 
 		 362 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1556  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  22.68 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0935  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 375 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458503  normal  0.516167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4019  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 367 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.612389 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2372  extracellular solute-binding protein  22.91 
 
 		 367 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984752  normal  0.0187734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2406  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1330  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1643  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  24.39 
 
 		 362 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1612  spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein, putative  22.3 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.875795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4758  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  25.47 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.263083  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  22.47 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0894  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0950  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.71 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.71 
 
 		 369 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1645  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 		 396 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222493  normal  0.608221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1819  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 359 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2968  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 356 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.897922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 364 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 366 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  22.3 
 
 		 353 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4922  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0375  extracellular solute-binding protein family 1  22.33 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00751674  decreased coverage  0.000421612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3145  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1566  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.127283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1367  transcription factor jumonji, jmjC  24.35 
 
 		 365 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  22.22 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2226  spermidine/putrescine ABC transporter, spermidine/putrescine-binding protein  20.13 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1938  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein precursor  20.13 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1846  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0748296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0340  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  21.93 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 367 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  21.82 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  20.58 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 362 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1011  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.71 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1030  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.71 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0982  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.71 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2300  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1193  extracellular solute-binding protein  24.13 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00611018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  21.9 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1287  spermidine/putrescine-binding periplasmic protein  22.58 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.180605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0392  polyamine transport protein  20.7 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2607  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  23.47 
 
 		 367 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>