More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_03855 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0386  periplasmic polyamine binding protein  93.2 
 
 
353 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03855  periplasmic polyamine binding protein  100 
 
 
353 aa  714    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0340  extracellular solute-binding protein  72.24 
 
 
352 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.988078 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1958  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  40.12 
 
 
369 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1692  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  40.12 
 
 
369 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.69 
 
 
369 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2730  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.69 
 
 
369 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1563  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.69 
 
 
369 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5307  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  37.46 
 
 
365 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4865  extracellular solute-binding protein  37.18 
 
 
365 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2642  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  39.82 
 
 
366 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00909614  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2386  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.54 
 
 
369 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2287  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.25 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0882  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2788  extracellular solute-binding protein family 1  37.68 
 
 
370 aa  253  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1011  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.9 
 
 
371 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0982  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.9 
 
 
371 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1030  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.9 
 
 
371 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.491177  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2477  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  253  3e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.996224  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0926  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0914  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.9 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00859  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1010  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274464  normal  0.285031 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2742  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.602994  normal  0.252845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0957  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  37.68 
 
 
370 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00865  hypothetical protein  37.68 
 
 
370 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0391  polyamine transport protein  35.75 
 
 
367 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03920  polyamine transport protein  35.75 
 
 
367 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.837862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0950  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.62 
 
 
371 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2898  extracellular solute-binding protein  36.77 
 
 
362 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5181  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.73 
 
 
365 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5088  extracellular solute-binding protein  36.73 
 
 
365 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.781791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1368  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  36.23 
 
 
370 aa  249  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3147  periplasmic polyamine-binding protein, putative  37.05 
 
 
362 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.718398  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0103  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  36.13 
 
 
369 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2567  extracellular solute-binding protein  37.05 
 
 
362 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3929  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  37.18 
 
 
363 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0132  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 
367 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.911312  normal  0.781797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5241  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 
365 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5390  extracellular solute-binding protein  38.64 
 
 
367 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110702  normal  0.0735387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46220  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.9 
 
 
363 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0209379  hitchhiker  0.00257917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5341  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  39.2 
 
 
367 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.169562  hitchhiker  0.0000795436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5250  extracellular solute-binding protein  39.2 
 
 
367 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0819  ABC transporter substrate binding protein (putrescine)  34.51 
 
 
371 aa  245  8e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0344  extracellular solute-binding protein  37.74 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.574749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2708  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.15362  normal  0.342608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2117  extracellular solute-binding protein  36.29 
 
 
365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.428561  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2829  extracellular solute-binding protein  35.88 
 
 
362 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3097  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0946  extracellular solute-binding protein  35.82 
 
 
366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2918  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000482793  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48760  Polyamine transporter periplasmic protein PotF  39.24 
 
 
371 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0282  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 
365 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.443093  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3000  extracellular solute-binding protein  35.85 
 
 
387 aa  242  6e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00190221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3542  extracellular solute-binding protein  39.71 
 
 
359 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1819  extracellular solute-binding protein  38.76 
 
 
359 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.523844  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3845  ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein, putative  35.42 
 
 
369 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.803653  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1094  extracellular solute-binding protein  34.82 
 
 
366 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.799805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5405  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 
370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.948456  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1645  putrescine transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  35.21 
 
 
369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0561958 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2195  periplasmic polyamine-binding protein, putative  39.41 
 
 
362 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.156454  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1061  extracellular solute-binding protein  35.57 
 
 
366 aa  239  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3031  extracellular solute-binding protein  35.56 
 
 
366 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1108  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 
366 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000316767  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1270  polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine-binding protein  34.72 
 
 
367 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1166  extracellular solute-binding protein  35.65 
 
 
366 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000290123  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2677  extracellular solute-binding protein  35.21 
 
 
361 aa  237  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0163621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1131  extracellular solute-binding protein  35.84 
 
 
366 aa  236  4e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5087  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.940444  normal  0.403458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3192  extracellular solute-binding protein family 1  35.38 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.683038  hitchhiker  0.00622676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5180  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.99 
 
 
364 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5404  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 
375 aa  236  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000245963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2188  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 
367 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414153  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2045  extracellular solute-binding protein  36.44 
 
 
367 aa  235  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.76929  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2337  extracellular solute-binding protein  33.15 
 
 
368 aa  235  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1199  extracellular solute-binding protein  35.38 
 
 
366 aa  235  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000384833  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1672  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 
364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285778  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5632  extracellular solute-binding protein  36.07 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0464998  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30570  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.07 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.720588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4671  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  35.21 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.728612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2607  putative periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  36.07 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0283  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 
401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5240  extracellular solute-binding protein  35.69 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1203  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
361 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4949  extracellular solute-binding protein family 1  36.05 
 
 
366 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597771  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1509  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
364 aa  233  5e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.168578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5050  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.18 
 
 
364 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0973  extracellular solute-binding protein  34.88 
 
 
366 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429024  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1767  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910155  normal  0.511303 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2179  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2310  putrescine-binding periplasmic protein precursor  33.9 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0345  extracellular solute-binding protein  37.1 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2123  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.44987  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1301  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.803761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1788  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  232  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4501  extracellular solute-binding protein family 1  35.21 
 
 
367 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.410168  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2513  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 
359 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137146  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2276  putrescine ABC transporter, periplasmic putrescine-binding protein  33.9 
 
 
364 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3928  extracellular solute-binding protein  34.49 
 
 
367 aa  231  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1018  extracellular solute-binding protein  33.9 
 
 
369 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>