More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0552 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 336 aa  658    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 356 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  26.07 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  24.21 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  25.31 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  24.03 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  25.71 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  25.24 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  22.51 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  33.54 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  22.71 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  25.79 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2726  ABC-2 type transporter  24.66 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  21.34 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1150  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.950793  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  27.44 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  24.09 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  27.4 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4696  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.508179  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  22.82 
 
 		 382 aa  62.8  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  21.76 
 
 		 387 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0530  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.203492  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  23.31 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  26.97 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4575  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  22.02 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  21.13 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  24.53 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  27.32 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  25.97 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  28.25 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  20.94 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1258  ABC-2 type transporter  23.17 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.793324  normal  0.287343 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  20.7 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  23.22 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  19.95 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  24.84 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0173  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3106  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708923  hitchhiker  0.000220198 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  24.52 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  23.46 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  21.66 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.18 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  25.16 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3151  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  20.93 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1265  ABC-type multidrug transport system, permease component  23.96 
 
 		 365 aa  57  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000431089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  25.44 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 381 aa  57  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  20.9 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  25.9 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1512  ABC-2 type transporter  23.43 
 
 		 369 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.179387  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1035  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.610155  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1519  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  23.12 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  26.38 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  24.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3273  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  26.73 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1780  ABC transporter, inner membrane subunit  24.54 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  28.3 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2625  ABC-2 type transporter  28.21 
 
 		 372 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  24.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  26.38 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  24.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  24.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  24.61 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4746  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  23.75 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2944  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.308426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>