74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0511 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0511  Pectate lyase/Amb allergen  100 
 
 		 365 aa  748    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000797817  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  38.82 
 
 		 482 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1848  Pectate lyase/Amb allergen  36.42 
 
 		 317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2436  Pectate lyase/Amb allergen  39.7 
 
 		 327 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00169439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0430  Pectate lyase/Amb allergen  33.79 
 
 		 335 aa  159  9e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202776  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0435  Pectate lyase/Amb allergen  31.78 
 
 		 375 aa  149  8e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.017738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0496  Pectinesterase  31.76 
 
 		 686 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  33.96 
 
 		 527 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2243  Pectate lyase/Amb allergen  31.71 
 
 		 462 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0247929  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.53 
 
 		 486 aa  135  8e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1493  pectate lyase  36.67 
 
 		 435 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  29.59 
 
 		 922 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0537  Pectate lyase/Amb allergen  35.34 
 
 		 351 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1087  pectate lyase/Amb allergen  36.62 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0821757  hitchhiker  0.00617992 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2763  Pectate lyase/Amb allergen  37.43 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.329046  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  31.72 
 
 		 991 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2764  Pectate lyase/Amb allergen  32.25 
 
 		 402 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429805  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1089  Pectate lyase/Amb allergen  30.09 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3434  Pectate lyase/Amb allergen  29.22 
 
 		 504 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2950  Pectate lyase/Amb allergen  31.77 
 
 		 554 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1090  Pectate lyase/Amb allergen  29.67 
 
 		 405 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  30.79 
 
 		 794 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07646  Pectate lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVN4]  35.02 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0153  pectate lyase/Amb allergen  33.49 
 
 		 449 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00741  Pectate lyase Precursor (EC 4.2.2.2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00645]  35.15 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1091  Pectate lyase/Amb allergen  27.19 
 
 		 392 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0495  Pectate lyase/Amb allergen  33.14 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.016328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6139  Pectate lyase  26.71 
 
 		 380 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1178  Pectate lyase/Amb allergen  30.88 
 
 		 498 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000219225 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2863  Pectate lyase/Amb allergen  31.08 
 
 		 522 aa  103  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.707547  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0942  ribosomal protein L18  29.8 
 
 		 769 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000113865  hitchhiker  0.00163221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0943  ribosomal protein S5  28.65 
 
 		 1316 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215001 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2566  Pectate lyase/Amb allergen  31.28 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5013  Pectate lyase/Amb allergen  33.52 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0132  Pectate lyase/Amb allergen  29.12 
 
 		 505 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1231  Pectate lyase/Amb allergen  34.62 
 
 		 919 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.218309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3821  Pectate lyase/Amb allergen  30.95 
 
 		 456 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  28.53 
 
 		 474 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  33.17 
 
 		 1409 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3958  Pectate lyase/Amb allergen  28.73 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3448  Pectate lyase-like  28.31 
 
 		 594 aa  97.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372442  hitchhiker  0.00149155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2168  pectate lyase  29.03 
 
 		 512 aa  96.7  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1843  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 730 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02650  pectate lyase  28.17 
 
 		 346 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2941  Pectate lyase/Amb allergen  31.25 
 
 		 501 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3858  Pectate lyase/Amb allergen  36.54 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4036  Pectate lyase/Amb allergen  32.28 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0353  Pectate lyase/Amb allergen  31.22 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3859  Pectate lyase/Amb allergen  32.28 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4035  Pectate lyase/Amb allergen  35.26 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.634971  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0271  Pectate lyase/Amb allergen  31.22 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0352  Pectate lyase/Amb allergen  30.53 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1371  Pectate lyase/Amb allergen  27.65 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00120054  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1777  Pectate lyase/Amb allergen  25.31 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04882  pectin lyase (Eurofung)  27.49 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0270  Pectate lyase/Amb allergen  29.1 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3881  Pectate lyase-like  34.51 
 
 		 747 aa  68.9  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000360789  normal  0.117799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3860  Pectate lyase/Amb allergen  31.52 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4037  Pectate lyase/Amb allergen  30.3 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3306  Pectate lyase/Amb allergen  30.06 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7394  Pectate lyase/Amb allergen  22.45 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0906839  normal  0.447007 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3839  type III helper protein HopAK1  26.76 
 
 		 543 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0281  hypothetical protein  28.14 
 
 		 143 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.342666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4281  pectate lyase  25.64 
 
 		 454 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3378  Pectate lyase/Amb allergen  23.7 
 
 		 314 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0280  AAA ATPase family protein  32.08 
 
 		 272 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.582677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3362  hypothetical protein  26.7 
 
 		 770 aa  47.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.142309  normal  0.0931446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4101  type III helper protein HopAK1  25.84 
 
 		 555 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4038  pectate lyase  27.84 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.647567  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10147  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 387 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.705837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3985  Pectate lyase/Amb allergen  33 
 
 		 421 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.971043  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02569  Pectin lyasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA61]  27.88 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3861  pectate lyase  27.85 
 
 		 431 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454243  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  24.38 
 
 		 682 aa  42.7  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>