280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2565 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  68.58 
 
 		 613 aa  863    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  100 
 
 		 612 aa  1220    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  56.21 
 
 		 650 aa  644    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  56.01 
 
 		 627 aa  650    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  56.34 
 
 		 620 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  47.1 
 
 		 608 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  38.3 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  37.56 
 
 		 620 aa  412  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 		 620 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  36.54 
 
 		 620 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  39.5 
 
 		 595 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.21 
 
 		 588 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.42 
 
 		 613 aa  287  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  31.1 
 
 		 611 aa  279  9e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  32.22 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  32.22 
 
 		 630 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  32.06 
 
 		 610 aa  273  5.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.63 
 
 		 610 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  31.97 
 
 		 611 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.8 
 
 		 623 aa  270  8e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  32.32 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 593 aa  262  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.18 
 
 		 612 aa  260  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  32.43 
 
 		 610 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.53 
 
 		 627 aa  259  1e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.8 
 
 		 619 aa  257  4e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  31.9 
 
 		 610 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  28.64 
 
 		 609 aa  257  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  32.48 
 
 		 610 aa  257  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.74 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  31.9 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  31.9 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  32.11 
 
 		 610 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  31.9 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.85 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  32.32 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  32.32 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  32.32 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  31.9 
 
 		 608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  31.9 
 
 		 608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.32 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  32.32 
 
 		 610 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.66 
 
 		 609 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  32.17 
 
 		 610 aa  251  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.01 
 
 		 610 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.16 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 602 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.94 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.53 
 
 		 596 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.51 
 
 		 609 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.48 
 
 		 619 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 		 588 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.12 
 
 		 592 aa  243  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.36 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.34 
 
 		 609 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.08 
 
 		 622 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.26 
 
 		 606 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.22 
 
 		 597 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29 
 
 		 616 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.29 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  29.72 
 
 		 604 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 605 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.01 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  30.77 
 
 		 609 aa  219  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  26.51 
 
 		 594 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  27.88 
 
 		 605 aa  214  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  27.56 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  29.04 
 
 		 581 aa  213  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.38 
 
 		 620 aa  212  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  27.8 
 
 		 621 aa  212  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.29 
 
 		 618 aa  211  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  27.82 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.64 
 
 		 632 aa  208  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.64 
 
 		 591 aa  206  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.27 
 
 		 586 aa  204  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.79 
 
 		 627 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.39 
 
 		 593 aa  204  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.25 
 
 		 614 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.25 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.53 
 
 		 588 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.91 
 
 		 591 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  27.45 
 
 		 600 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.55 
 
 		 589 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  31.12 
 
 		 545 aa  194  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.44 
 
 		 590 aa  194  5e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.1 
 
 		 590 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  27.41 
 
 		 601 aa  193  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  27.46 
 
 		 598 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  27.16 
 
 		 592 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  26.4 
 
 		 592 aa  190  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  26.4 
 
 		 592 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  27.68 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  26.96 
 
 		 592 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  25.35 
 
 		 596 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  26.96 
 
 		 592 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  28.18 
 
 		 593 aa  187  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  28.14 
 
 		 591 aa  187  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>