259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1484 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 384 aa  753    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  51.97 
 
 		 388 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  42.44 
 
 		 384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  41.36 
 
 		 384 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  44.53 
 
 		 387 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  40.8 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  42.22 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  42.93 
 
 		 384 aa  292  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  37.84 
 
 		 384 aa  290  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  42.74 
 
 		 379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 384 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  39.52 
 
 		 380 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  39.79 
 
 		 380 aa  279  5e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  38.79 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  41.69 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  39.21 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  41.16 
 
 		 376 aa  259  8e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  36.51 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  35.98 
 
 		 376 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  40.81 
 
 		 383 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  37.15 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  36.1 
 
 		 380 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  39.84 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  40.43 
 
 		 376 aa  242  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 		 380 aa  241  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 379 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  38.9 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  38.99 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  34.94 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  37.81 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  40.88 
 
 		 410 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  35.84 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  38.05 
 
 		 385 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1851  lipid-A-disaccharide synthase  40.22 
 
 		 382 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  40 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  34.66 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  41.42 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  41.18 
 
 		 380 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1459  lipid A disaccharide synthase LpxB  39.04 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1175  lipid-A-disaccharide synthase  39.04 
 
 		 375 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.165605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  35.06 
 
 		 380 aa  223  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  39.71 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  29.77 
 
 		 388 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 		 385 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  39.64 
 
 		 375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  39.41 
 
 		 375 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  40.24 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  39.41 
 
 		 375 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  38.53 
 
 		 375 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  37.43 
 
 		 372 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  33.59 
 
 		 383 aa  216  7e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  36.02 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.81 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 		 385 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  35.17 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  35.09 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  39.64 
 
 		 378 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.35 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.56 
 
 		 382 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  32.61 
 
 		 379 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  37.13 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  30.27 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  33.16 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 383 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  39.76 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  34.56 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1455  lipid-A-disaccharide synthase  38.9 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 376 aa  209  5e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  35.76 
 
 		 388 aa  209  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 		 377 aa  209  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.35 
 
 		 379 aa  209  9e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  38.15 
 
 		 390 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  40.12 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  33.61 
 
 		 382 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  34.05 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.63 
 
 		 382 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  34.67 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1695  lipid-A-disaccharide synthase  36.12 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0679136  normal  0.244095 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 389 aa  206  4e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1448  lipid-A-disaccharide synthase  38.29 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000462507  normal  0.282438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2442  lipid-A-disaccharide synthase  35.85 
 
 		 389 aa  206  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.108116  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  30.62 
 
 		 370 aa  205  9e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3777  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0300164  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  35.83 
 
 		 398 aa  203  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  36.29 
 
 		 384 aa  203  5e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  36.23 
 
 		 385 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0922  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  32 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.57 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  36.11 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  37.7 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  35.83 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0520  lipid-A-disaccharide synthase  36.73 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.884681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>