126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1206 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1206  TPR domain-containing protein  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.417505  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2418  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.1 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0304  tetratricopeptide repeat domain protein  26.43 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.4 
 
 
810 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
187 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  30.28 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
878 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
216 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
758 aa  56.2  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
522 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 
374 aa  55.1  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 
297 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 
522 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.88 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.17 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.5 
 
 
2401 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
200 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.39 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
208 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 
520 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.12 
 
 
190 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  28.38 
 
 
219 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  28.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  28.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4475  TPR domain protein  28.38 
 
 
219 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000190548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  25.4 
 
 
196 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.91 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  27.7 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
219 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
927 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.44 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  23.39 
 
 
190 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  31.52 
 
 
329 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 
518 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  27.7 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  27.91 
 
 
222 aa  50.1  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
543 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
394 aa  49.3  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 
279 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 
205 aa  49.3  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 
722 aa  48.9  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.81 
 
 
190 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  23.53 
 
 
436 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
4079 aa  48.1  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1872  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 
594 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0261679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
883 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  23.56 
 
 
745 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.47 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2747  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  24.29 
 
 
340 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 
465 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
562 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.35 
 
 
632 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
1034 aa  46.6  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.87 
 
 
1979 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 
677 aa  46.6  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.74 
 
 
626 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04192  DnaJ and TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G05900)  29.09 
 
 
634 aa  45.8  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.107548  normal  0.45593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.08 
 
 
1694 aa  45.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  30.77 
 
 
222 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
393 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
219 aa  45.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  36.36 
 
 
474 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 
466 aa  45.4  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
1005 aa  45.4  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
808 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
827 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  29.38 
 
 
870 aa  45.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.26 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  25.17 
 
 
1067 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.84 
 
 
1737 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
804 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0158  tetratricopeptide repeat protein  30.63 
 
 
400 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.185124  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 
639 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.88 
 
 
1138 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  31.87 
 
 
542 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
466 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
968 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
534 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.42 
 
 
820 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.66 
 
 
818 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 
917 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.15 
 
 
730 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  28.95 
 
 
1101 aa  43.1  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 
567 aa  43.1  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.14 
 
 
725 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 
621 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 
1161 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  22.73 
 
 
833 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.71 
 
 
339 aa  43.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 
1069 aa  42.7  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>