260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0953 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0953  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 354 aa  687    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  30.97 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 442 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  29.12 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0796  inner-membrane translocator  28.22 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.511311  normal  0.608951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1977  inner-membrane translocator  29.01 
 
 		 369 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2377  inner-membrane translocator  27.62 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  26.96 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  25.23 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  28.04 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 391 aa  99.8  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  28.05 
 
 		 344 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  26.01 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  25.97 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  28.49 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  24.57 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1119  inner-membrane translocator  26.53 
 
 		 364 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2499  inner-membrane translocator  28.41 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  23.01 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  28.3 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  27.71 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2174  transmembrane ABC transporter protein  27.2 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2018  inner-membrane translocator  26.53 
 
 		 363 aa  94  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  26.87 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0804  putative transmembrane ABC transporter protein  26.12 
 
 		 387 aa  94  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3628  inner-membrane translocator  25.42 
 
 		 343 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  26.25 
 
 		 351 aa  92.4  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0839  inner-membrane translocator  27.24 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  27.44 
 
 		 377 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  25.14 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  25.14 
 
 		 344 aa  90.9  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5056  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 363 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  24.91 
 
 		 347 aa  89.4  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1904  inner-membrane translocator  26.79 
 
 		 364 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246976  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4443  inner-membrane translocator  25.55 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0008  ABC transporter, permease protein, putative  24.76 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  26.57 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  25.3 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  27.18 
 
 		 347 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0005  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.226328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2167  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  24.92 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  28.81 
 
 		 356 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3631  inner-membrane translocator  24.92 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0144  inner-membrane translocator  26.75 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 		 365 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  26.54 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  24.64 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  27.52 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  27.16 
 
 		 350 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  25.26 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  25.26 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  26.92 
 
 		 372 aa  84  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  25.94 
 
 		 368 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1120  inner-membrane translocator  24.12 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1901  inner-membrane translocator  27.86 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.415582  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  26.05 
 
 		 426 aa  83.6  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  25.59 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  24.93 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3174  inner-membrane translocator  25.94 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.480472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  25.34 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  25.29 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0680  inner-membrane translocator  25.79 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00660304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2146  inner-membrane translocator  25.46 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.387266  normal  0.486606 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  25.88 
 
 		 360 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  25.88 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3947  inner-membrane translocator  26.99 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070874 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6463  inner-membrane translocator  27.31 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.665184  normal  0.388851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2059  ABC transporter permease  24.35 
 
 		 363 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.271425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0784  inner-membrane translocator  25.18 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  24 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1037  inner-membrane translocator  28.11 
 
 		 360 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  26.64 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  25 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4467  inner-membrane translocator  25.3 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.187489 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0569  ABC transporter, permease protein  24.25 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  22.42 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  22.92 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  28.47 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3902  inner-membrane translocator  27.54 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  24.61 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0534  ABC transporter, permease protein  23.47 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  24.41 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  25.19 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1356  inner-membrane translocator  26.34 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4193  inner-membrane translocator  29.31 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2767  inner-membrane translocator  26.09 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2036  inner-membrane translocator  25.09 
 
 		 403 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  24.09 
 
 		 365 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2136  inner-membrane translocator  26.84 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1004  ABC transporter, inner membrane subunit  25.58 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1692  inner-membrane translocator  23.87 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108076  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  27.89 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  26.17 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3539  inner-membrane translocator  23.1 
 
 		 371 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  24.01 
 
 		 366 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5875  inner-membrane translocator  25.71 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  23.71 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1062  inner-membrane translocator  26.15 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1717  inner-membrane translocator  27.03 
 
 		 361 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>