More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0823 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  56.92 
 
 		 132 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  57.36 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  56.15 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  53.54 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 130 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 142 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  54.26 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  51.56 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 130 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 131 aa  142  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  48.84 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  46.51 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  51.59 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  48.12 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  44.09 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  42.19 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 176 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.34 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.34 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25.38 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 136 aa  62  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.68 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  31.5 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.25 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  31.78 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.23 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  30.17 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  29.46 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  32.5 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.19 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>