104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  86.05 
 
 		 185 aa  301  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  44.09 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 167 aa  58.2  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 137 aa  49.7  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 162 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 154 aa  48.9  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5322  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 152 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 153 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 154 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  37.8 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  30.38 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.22 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3512  transcriptional regulator, MarR family  25.51 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 149 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  35.37 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 139 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9049  Transcriptional regulator  30.68 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578092  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 		 165 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  27.93 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  26.47 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  26.47 
 
 		 144 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 153 aa  45.1  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 151 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 149 aa  44.7  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  27.36 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  32.76 
 
 		 141 aa  43.1  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 138 aa  42.4  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  42.68 
 
 		 133 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 163 aa  42  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 164 aa  42  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 173 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 138 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  27.55 
 
 		 176 aa  42  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 137 aa  41.6  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  30.3 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  41.2  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>