More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0416 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  40.83 
 
 		 1068 aa  665    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  100 
 
 		 896 aa  1811    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0642  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 		 1385 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1268  sensor histidine kinase/response regulator  30.12 
 
 		 1016 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375784  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.04 
 
 		 946 aa  331  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 1014 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.09 
 
 		 1763 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  35.9 
 
 		 1177 aa  323  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.59 
 
 		 1363 aa  320  7.999999999999999e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.17 
 
 		 1313 aa  318  3e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 		 818 aa  317  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 929 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 818 aa  314  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 		 833 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 1768 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 1369 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.27 
 
 		 1346 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.49 
 
 		 1069 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  34.96 
 
 		 1765 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  34.35 
 
 		 925 aa  303  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.26 
 
 		 923 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 1765 aa  303  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1203 aa  303  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 		 1266 aa  303  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  36.05 
 
 		 852 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.84 
 
 		 1442 aa  302  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  34.17 
 
 		 925 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  32.71 
 
 		 847 aa  300  9e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.45 
 
 		 927 aa  300  9e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.17 
 
 		 2213 aa  299  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 1767 aa  299  2e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 		 1771 aa  299  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 1767 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  35.26 
 
 		 1135 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.89 
 
 		 1767 aa  298  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 812 aa  298  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 		 991 aa  297  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1240 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 		 990 aa  296  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1611 aa  296  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 1251 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 		 758 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1016 aa  295  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  34.57 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 		 1202 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  33.92 
 
 		 917 aa  295  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 		 893 aa  294  6e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 1255 aa  293  7e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  34.01 
 
 		 1001 aa  293  8e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 		 921 aa  293  9e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  33.39 
 
 		 917 aa  293  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.78 
 
 		 929 aa  293  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  34.54 
 
 		 932 aa  293  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.28 
 
 		 932 aa  292  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 928 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34 
 
 		 1550 aa  292  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 		 830 aa  292  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.64 
 
 		 721 aa  291  3e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 816 aa  291  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 		 916 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.61 
 
 		 936 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 1782 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1245 aa  290  6e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.48 
 
 		 1109 aa  290  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 1057 aa  290  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 1128 aa  290  7e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  34.94 
 
 		 1407 aa  289  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.67 
 
 		 937 aa  289  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 		 1236 aa  289  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  33.14 
 
 		 905 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 		 1234 aa  287  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.58 
 
 		 1331 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.87 
 
 		 927 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1238 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  34.72 
 
 		 1297 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1238 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.94 
 
 		 1238 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.96 
 
 		 1397 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 1234 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 1582 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  34.64 
 
 		 1188 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.46 
 
 		 916 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1238 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 1784 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.47 
 
 		 918 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0528  hybrid sensory histidine kinase BarA  35.17 
 
 		 926 aa  283  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.178759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 		 752 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 1245 aa  283  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03340  protein-histidine kinase, putative  34.48 
 
 		 1390 aa  282  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.38 
 
 		 922 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1236 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1236 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 		 705 aa  282  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 1236 aa  282  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.57 
 
 		 796 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 909 aa  281  3e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.71 
 
 		 1499 aa  281  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  33.77 
 
 		 1200 aa  281  3e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  34.46 
 
 		 1236 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.97 
 
 		 1786 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>