More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1268 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1268  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 
1016 aa  2023    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.375784  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  33.58 
 
 
1068 aa  522  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0642  sensor histidine kinase/response regulator  35.1 
 
 
1385 aa  432  1e-119  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  30.12 
 
 
896 aa  370  1e-100  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  30.93 
 
 
765 aa  227  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
818 aa  225  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.43 
 
 
937 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 
946 aa  221  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.12 
 
 
933 aa  220  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.92 
 
 
852 aa  219  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.7 
 
 
969 aa  218  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2370  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
899 aa  217  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.382891  normal  0.337313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  27.59 
 
 
925 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.81 
 
 
927 aa  216  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 
758 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
818 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  27.15 
 
 
925 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  31.4 
 
 
1331 aa  214  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  29.38 
 
 
850 aa  214  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 
916 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  27.61 
 
 
932 aa  213  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.23 
 
 
1069 aa  212  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.65 
 
 
816 aa  212  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 
1369 aa  212  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 
1398 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1203 aa  211  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.78 
 
 
948 aa  211  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.77 
 
 
1346 aa  210  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.89 
 
 
812 aa  210  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3226  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 
1251 aa  210  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0796968  normal  0.806997 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 
1340 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
1234 aa  209  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 
1040 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.53 
 
 
1230 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  40.78 
 
 
1135 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
1245 aa  209  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  47.52 
 
 
1188 aa  209  3e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.92 
 
 
917 aa  209  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  29.24 
 
 
737 aa  209  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
1238 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
1236 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
1236 aa  208  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.52 
 
 
1236 aa  208  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  35.71 
 
 
1560 aa  208  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 
1238 aa  208  5e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
1768 aa  208  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 
1238 aa  208  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
1255 aa  207  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.91 
 
 
1238 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.25 
 
 
1407 aa  207  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  27.87 
 
 
940 aa  207  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  46.69 
 
 
1236 aa  207  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
882 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  27.85 
 
 
932 aa  207  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 
1271 aa  206  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  41.15 
 
 
833 aa  206  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.74 
 
 
941 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2240  sensor/response regulator hybrid  28.55 
 
 
942 aa  206  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 
993 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
685 aa  206  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
1363 aa  206  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.68 
 
 
682 aa  205  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.8 
 
 
1763 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2682  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
827 aa  204  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.616307  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.94 
 
 
1765 aa  204  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  45.31 
 
 
1200 aa  204  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73542  histidine kinase osmosensor  31.07 
 
 
1118 aa  204  7e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  28.62 
 
 
1122 aa  204  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4243  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.12 
 
 
653 aa  204  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.506182  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
909 aa  204  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 
1202 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.93 
 
 
1792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  37.87 
 
 
606 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
1267 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.72 
 
 
1442 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.39 
 
 
893 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 
1782 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
1611 aa  202  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
721 aa  202  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 
1234 aa  202  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  41.41 
 
 
982 aa  202  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.21 
 
 
916 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1326 aa  201  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04479  Histidine kinase J7 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6WJ24]  30.43 
 
 
1297 aa  201  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930158  normal  0.687649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  27.41 
 
 
955 aa  201  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  27.8 
 
 
917 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 
922 aa  201  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
785 aa  201  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
1786 aa  201  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.92 
 
 
846 aa  201  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.1 
 
 
1309 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.54 
 
 
1784 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.25 
 
 
1765 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  28.04 
 
 
914 aa  200  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.93 
 
 
1397 aa  200  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.75 
 
 
778 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 
914 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  42.92 
 
 
1353 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  47.3 
 
 
736 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  25.79 
 
 
847 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>