106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2442 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  100 
 
 		 762 aa  1474    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 1119 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 578 aa  107  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 1060 aa  90.9  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  21.94 
 
 		 2145 aa  90.1  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.88 
 
 		 810 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1238 aa  88.2  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.25 
 
 		 878 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  29.36 
 
 		 994 aa  80.9  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.35 
 
 		 1266 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.54 
 
 		 725 aa  77.8  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 639 aa  74.3  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 1437 aa  69.7  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.85 
 
 		 1611 aa  69.3  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 		 1694 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 702 aa  67.8  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1550 aa  67  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.32 
 
 		 991 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.65 
 
 		 828 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  26.34 
 
 		 1180 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.68 
 
 		 493 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 1147 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  27.73 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  22.04 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.97 
 
 		 1507 aa  58.9  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1404 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  29.89 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  25.16 
 
 		 689 aa  57.4  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  20.41 
 
 		 957 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  26.3 
 
 		 941 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  25.35 
 
 		 490 aa  55.8  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.74 
 
 		 1007 aa  55.1  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 465 aa  55.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 1526 aa  54.7  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  24.27 
 
 		 1212 aa  54.7  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3737  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 		 742 aa  54.3  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  24.3 
 
 		 1087 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 1285 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  22.19 
 
 		 985 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  19.04 
 
 		 782 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 927 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  34.43 
 
 		 404 aa  51.2  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 637 aa  51.2  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 512 aa  50.8  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.01 
 
 		 397 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 		 412 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 1486 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 		 1295 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.26 
 
 		 968 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  21.59 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  18.1 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 2413 aa  49.3  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.33 
 
 		 931 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 362 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 486 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 1360 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  23.31 
 
 		 543 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.84 
 
 		 632 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 323 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 850 aa  48.5  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  28.36 
 
 		 875 aa  48.1  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0148  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.37 
 
 		 560 aa  48.5  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.189493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  26.64 
 
 		 788 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 594 aa  48.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 574 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1676 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 718 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25.79 
 
 		 816 aa  47.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 681 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  25.76 
 
 		 577 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  35.9 
 
 		 1020 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 833 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 715 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 767 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.06 
 
 		 1186 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  24.05 
 
 		 665 aa  46.6  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 1082 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  26.84 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 1063 aa  46.2  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 4079 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  27.82 
 
 		 953 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  26.07 
 
 		 725 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 685 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.71 
 
 		 626 aa  45.8  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  23.45 
 
 		 865 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 828 aa  46.2  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  32.85 
 
 		 956 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.11 
 
 		 1279 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1123 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 444 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  28.88 
 
 		 620 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.82 
 
 		 824 aa  45.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  23.53 
 
 		 919 aa  45.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 620 aa  45.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.56 
 
 		 990 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4905  Tetratricopeptide TPR_4  27.24 
 
 		 754 aa  45.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 924 aa  44.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 578 aa  44.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.556982 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>