More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2195 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  100 
 
 		 386 aa  747    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  63.17 
 
 		 392 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  63.94 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  59.41 
 
 		 404 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  56.07 
 
 		 391 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  54.92 
 
 		 391 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  50.64 
 
 		 390 aa  330  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  46.51 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  44.44 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  43 
 
 		 402 aa  235  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  37.6 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  36.36 
 
 		 380 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  39.12 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  33.5 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  34.78 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  35.17 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  29.72 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  30.91 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  32.82 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.38 
 
 		 403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
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NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  29.87 
 
 		 393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  33.42 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  28.61 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  28.3 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.5 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.47 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  32.08 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
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NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.22 
 
 		 414 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.3 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  29.01 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.02 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.62 
 
 		 388 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  29.49 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  29.49 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.06 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.4 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.77 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  34.41 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
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NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.56 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.17 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  34.88 
 
 		 332 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.08 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  27.46 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.93 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.93 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.01 
 
 		 387 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.18 
 
 		 403 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  28.02 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.45 
 
 		 410 aa  97.1  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.74 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.45 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0212  transcription regulator ROK family protein  29.21 
 
 		 416 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  27.8 
 
 		 401 aa  96.7  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.06 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25 
 
 		 391 aa  96.3  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  23.12 
 
 		 387 aa  95.5  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.34 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  29.67 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2589  ROK  29.13 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0163398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.63 
 
 		 395 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  32.1 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  27.87 
 
 		 318 aa  93.2  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  31.28 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  28.19 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.39 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  29.74 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.04 
 
 		 422 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  28.53 
 
 		 373 aa  91.3  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.04 
 
 		 403 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  28.19 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  30.79 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.71 
 
 		 396 aa  89.7  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  27.93 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  27.93 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  27.93 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.49 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  27.93 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.91 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  32 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7454  transcriptional regulator ROK family  26.16 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  27.98 
 
 		 381 aa  86.7  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.32 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.67 
 
 		 435 aa  86.3  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.78 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.25 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.4 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  29.8 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.81 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  26.72 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.579561 
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.64 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.9 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_0421  ROK  22.94 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  30.95 
 
 		 390 aa  82.8  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  26.35 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  30.29 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.94 
 
 		 384 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
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NC_010084  Bmul_1710  ROK family protein  27.15 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.965382  normal  0.0458779 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.07 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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