133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1825 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
168 aa  348  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  77.3 
 
 
332 aa  268  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  78.05 
 
 
175 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  78.05 
 
 
175 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  78.05 
 
 
175 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  78.05 
 
 
175 aa  267  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  78.05 
 
 
175 aa  266  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  77.44 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  77.44 
 
 
175 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  77.3 
 
 
335 aa  264  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  75 
 
 
334 aa  264  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  80.65 
 
 
165 aa  262  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  80 
 
 
175 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  75.93 
 
 
180 aa  254  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  74.85 
 
 
169 aa  254  4e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  71.86 
 
 
329 aa  246  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  50.99 
 
 
157 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  52.03 
 
 
156 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
159 aa  155  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  49.34 
 
 
178 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  53.33 
 
 
157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
158 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
158 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  45.86 
 
 
167 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  41.67 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.91 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  36.77 
 
 
233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  39.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  38.06 
 
 
152 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  39.39 
 
 
144 aa  104  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  37.31 
 
 
140 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  40.15 
 
 
167 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  42.22 
 
 
155 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  48.11 
 
 
158 aa  98.6  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  42.86 
 
 
319 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  46.6 
 
 
304 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  45.63 
 
 
295 aa  90.9  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  35.57 
 
 
162 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  43.52 
 
 
301 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.19 
 
 
167 aa  87.8  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  32.59 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32.59 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  31.75 
 
 
188 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.83 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35.23 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  30.83 
 
 
141 aa  57.8  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  25.78 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  25 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  29.29 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
138 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
152 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  28.8 
 
 
166 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
155 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  26.77 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  28.8 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
168 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  30.23 
 
 
139 aa  50.8  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
144 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  29.37 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0578  hypothetical protein  29.37 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  29.25 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
173 aa  49.7  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4343  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4185  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4164  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4236  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4283  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3505  hypothetical protein  27.27 
 
 
162 aa  48.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.168583  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
154 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  35.63 
 
 
151 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  31.19 
 
 
138 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
167 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  28.81 
 
 
156 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  31.3 
 
 
162 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  26.05 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  35.59 
 
 
126 aa  45.4  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03699  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4159  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
191 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3976  hypothetical protein  30.86 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00660119  normal  0.634827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03648  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5261  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.712373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4188  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4187  hypothetical protein  29.57 
 
 
155 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0132794 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4287  hypothetical protein  29.57 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4044  hypothetical protein  29.57 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4341  hypothetical protein  29.57 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  24.64 
 
 
156 aa  44.7  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3831  hypothetical protein  23.38 
 
 
154 aa  44.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
160 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>