More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0727 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0727  inner-membrane translocator  100 
 
 		 376 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.1031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3585  ABC transporter inner-membrane translocator  85.64 
 
 		 376 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1299  ABC transporter inner-membrane translocator  83.65 
 
 		 377 aa  641    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0634  inner-membrane translocator  60.28 
 
 		 365 aa  450  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000284112 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3338  inner-membrane translocator  54.32 
 
 		 377 aa  385  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.945315  normal  0.666399 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2844  integral inner-membrane protein  53.74 
 
 		 372 aa  382  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.746022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4172  inner-membrane translocator  52.96 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0859  inner-membrane translocator  57.14 
 
 		 362 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3653  inner-membrane translocator  54.84 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.483101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0259  ABC transporter membrane spanning protein (sugar/ribonucleotide)  57.23 
 
 		 376 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4460  inner-membrane translocator  51.83 
 
 		 367 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.628382  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3096  inner-membrane translocator  51.64 
 
 		 364 aa  358  6e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2284  inner-membrane translocator  53.68 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.332581  normal  0.870366 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0884  inner-membrane translocator  54.22 
 
 		 364 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.758855  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2209  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  53.68 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0526  inner-membrane translocator  53.01 
 
 		 392 aa  332  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0563  inner-membrane translocator  50.95 
 
 		 367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0808252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1154  inner-membrane translocator  40.97 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.426445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0422  inner-membrane translocator  39.01 
 
 		 391 aa  232  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.975365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08790  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000274602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0750  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00540188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1951  inner-membrane translocator  35.8 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563372 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0843  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0820  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 344 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0018  inner-membrane translocator  35.51 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1632  inner-membrane translocator  34.01 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0157  inner-membrane translocator  40.84 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.700557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0006  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0191826  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1447  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.375364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1948  ABC transporter, permease protein  36.23 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.476576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3052  inner-membrane translocator  35.05 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1550  ABC transporter permease  35.59 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.405583  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3691  inner-membrane translocator  34.62 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.83673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1830  ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.590478  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1780  inner-membrane translocator  33.63 
 
 		 357 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000259791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2175  inner-membrane translocator  34.44 
 
 		 364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.630634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6737  inner-membrane translocator  39.43 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.520538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1319  inner-membrane translocator  32.87 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2934  inner-membrane translocator  33.43 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0403  inner-membrane translocator  33.83 
 
 		 352 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00495406  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0138  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.05 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.619056  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4193  inner-membrane translocator  38.46 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1499  membrane protein  35.46 
 
 		 345 aa  160  5e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.700858  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0992  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 342 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1139  inner-membrane translocator  37.74 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0911886  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2070  inner-membrane translocator  38.14 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04910  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  36.58 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0505  inner-membrane translocator  34.32 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1787  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1212  inner-membrane translocator  39.59 
 
 		 462 aa  155  8e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000448619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1148  inner-membrane translocator  34.9 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1077  inner-membrane translocator  31.86 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1580  inner-membrane translocator  33.33 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0212662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0809  inner-membrane translocator  38.87 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05410  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.27 
 
 		 364 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1946  permease component of branched-chain amino acid transport system  34.74 
 
 		 349 aa  152  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.251355  hitchhiker  0.000358209 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2320  inner-membrane translocator  31.45 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.434306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1939  ABC transporter, inner membrane subunit  31.45 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1925  inner-membrane translocator  32.18 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.633833  normal  0.690286 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3656  inner-membrane translocator  33.04 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.106074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1530  inner-membrane translocator  34.34 
 
 		 345 aa  151  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1678  inner-membrane translocator  39.15 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.662274  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1987  inner-membrane translocator  34.28 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.426969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2786  inner-membrane translocator  37.1 
 
 		 349 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.569125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0031  inner-membrane translocator  31.94 
 
 		 357 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1453  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  34.22 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1690  inner-membrane translocator  32.29 
 
 		 665 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1178  inner-membrane translocator  37.13 
 
 		 356 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1290  inner-membrane translocator  31.11 
 
 		 350 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79178  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2602  inner-membrane translocator  36.81 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.815607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0996  inner-membrane translocator  36.15 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1022  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1183  inner-membrane translocator  34.25 
 
 		 340 aa  143  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.555245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1302  inner-membrane translocator  34.81 
 
 		 347 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00194364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0495  inner-membrane translocator  31.53 
 
 		 360 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0472757 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3177  inner-membrane translocator  32.61 
 
 		 358 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.290387  normal  0.329303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0343  putative ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.28 
 
 		 347 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0672  inner-membrane translocator  29.72 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1271  sugar ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 383 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745875  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3237  inner-membrane translocator  34.38 
 
 		 528 aa  139  7e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.941278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0637  inner-membrane translocator  29.8 
 
 		 377 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1408  inner-membrane translocator  31.87 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0027167  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07940  nucleoside ABC transporter membrane protein  36.39 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3558  ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.31458  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3241  inner-membrane translocator  30.89 
 
 		 360 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.366513  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0768  ABC transporter, permease protein, putative  29.72 
 
 		 366 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0753  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 441 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1608  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.39 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.430201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25740  nucleoside ABC transporter membrane protein  34.81 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.718562  normal  0.424748 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4009  inner-membrane translocator  32.28 
 
 		 365 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0858  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  32.03 
 
 		 355 aa  133  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3175  inner-membrane translocator  35.59 
 
 		 379 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.390246  normal  0.626931 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0297  inner-membrane translocator  33.79 
 
 		 388 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000082551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3165  inner-membrane translocator  31.23 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.786716  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3944  hypothetical protein  28.46 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.121867  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3560  inner-membrane translocator  30.47 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.317487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6452  inner-membrane translocator  33.06 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0953  inner-membrane translocator  35.42 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.267238  normal  0.301742 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0474  inner-membrane translocator  30.77 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000000132511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1699  inner-membrane translocator  35.88 
 
 		 363 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0601171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>