191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5848 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 176 aa  346  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  43.24 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  44.59 
 
 		 192 aa  84.7  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  39.19 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  34.41 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  34.69 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  36.36 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  36.78 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  37.14 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  31.82 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  34.62 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  35.62 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 215 aa  67.4  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  34.24 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  35.14 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  36 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  32.68 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  31.85 
 
 		 179 aa  64.7  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  33.76 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  39.22 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  35.19 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  30.71 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0533  2',5' RNA ligase  30 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.883714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  30 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  31.97 
 
 		 190 aa  62  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  36.23 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  30.71 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  33.09 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.56 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.79 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  31.14 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  33.12 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  38.56 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  35.42 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  31.9 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.76 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.76 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.13 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1922  2'-5' RNA ligase  30.28 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  34.08 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0814  2',5' RNA ligase  32.69 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429947  hitchhiker  0.00104301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2974  putative 2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  29.2 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1975  2',5' RNA ligase  29.03 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.414685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  33.98 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  30.88 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3011  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.49 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  34.86 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  29.5 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  26.99 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3712  2'-5' RNA ligase  36.62 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  26.38 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  37.19 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3743  2'-5' RNA ligase  36.62 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  32.87 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0408  2'-5' RNA ligase  30.37 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  30.46 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  27.41 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.81 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  21.77 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  31.58 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  38.95 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  28.45 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2732  hypothetical protein  35.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  27.14 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3219  hypothetical protein  35.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1770  hypothetical protein  35.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3686  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2784  2'-5' RNA ligase  35.92 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  26.67 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  28.66 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  22.45 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0261  2'-5' RNA ligase  31.61 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00684061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0184  2',5' RNA ligase  29.3 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  34.74 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  35.61 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  28.33 
 
 		 190 aa  52.4  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  33.66 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  23.81 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  27.89 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_004310  BR0084  hypothetical protein  29.41 
 
 		 196 aa  51.6  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.514694  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  28.21 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  36.94 
 
 		 186 aa  51.6  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.13 
 
 		 181 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  29.87 
 
 		 220 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0081  2'-5' RNA ligase  29.41 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>