245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3449 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 		 377 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  58.71 
 
 		 368 aa  454  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  54.01 
 
 		 376 aa  396  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  50.8 
 
 		 378 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  49.87 
 
 		 367 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  48.54 
 
 		 371 aa  357  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  47.75 
 
 		 370 aa  353  4e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  45.48 
 
 		 370 aa  345  6e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  47.49 
 
 		 372 aa  345  1e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2162  lipid A disaccharide synthase  42.04 
 
 		 383 aa  271  9e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  37.63 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  36.53 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  40.11 
 
 		 389 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 		 402 aa  247  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  37.3 
 
 		 383 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  39.05 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  35.53 
 
 		 372 aa  228  9e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  35 
 
 		 378 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  36.13 
 
 		 380 aa  225  9e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  35.66 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 		 380 aa  222  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  37.61 
 
 		 376 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  36.98 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  33.07 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 		 383 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  37.69 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  34.41 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 		 382 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  34.04 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2052  lipid-A-disaccharide synthase  35.01 
 
 		 376 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.916961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  35.5 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 		 380 aa  209  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  36.84 
 
 		 388 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 		 383 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  34.47 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 381 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0040  lipid-A-disaccharide synthase  36.9 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  34.59 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  33.33 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2963  lipid-A-disaccharide synthase  35.98 
 
 		 381 aa  206  7e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.21352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0576  lipid-A-disaccharide synthase  35.2 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.019099  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  34.55 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  31.1 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  34.65 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3095  lipid-A-disaccharide synthase  33.24 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.335971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2349  lipid-A-disaccharide synthase  32.89 
 
 		 358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 		 384 aa  197  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1599  Lipid-A-disaccharide synthase  32.56 
 
 		 407 aa  194  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  31.5 
 
 		 411 aa  193  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5044  lipid-A-disaccharide synthase  34.74 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 375 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4678  lipid-A-disaccharide synthase  34.88 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.110539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.28 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  32.22 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  35.83 
 
 		 377 aa  189  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002760  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 379 aa  189  8e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  35.45 
 
 		 375 aa  189  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03224  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 		 379 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5143  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.0410721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5220  lipid-A-disaccharide synthase  34.19 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  31.55 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  32.16 
 
 		 376 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  29.92 
 
 		 382 aa  186  8e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3737  lipid-A-disaccharide synthase  31.93 
 
 		 385 aa  185  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.927535  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  36.25 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  34.02 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  32.89 
 
 		 380 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1273  lipid-A-disaccharide synthase  32.5 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  32.25 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3152  lipid-A-disaccharide synthase  32.66 
 
 		 383 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00776372  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  33.94 
 
 		 375 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.11 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0098  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.540012  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  31.38 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  34.3 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0943  lipid-A-disaccharide synthase  32.84 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3434  lipid-A-disaccharide synthase  34.43 
 
 		 392 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.293347  normal  0.272129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2414  lipid-A-disaccharide synthase  32.75 
 
 		 383 aa  179  7e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1838  lipid-A-disaccharide synthase  31.4 
 
 		 379 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.812439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  34.52 
 
 		 380 aa  177  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  34.01 
 
 		 378 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  31.85 
 
 		 384 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4504  lipid-A-disaccharide synthase  32.3 
 
 		 397 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0720  lipid-A-disaccharide synthase  33.53 
 
 		 382 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0165687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  30.42 
 
 		 388 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  32.63 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3421  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000156785  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.44 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0186  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000405274  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0184  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 382 aa  176  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000688697  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00180  lipid-A-disaccharide synthase  33.73 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000177089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>