119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3408 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  100 
 
 		 363 aa  745    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  40.41 
 
 		 378 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  41.82 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  41.22 
 
 		 371 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  35.45 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  41.96 
 
 		 224 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  34.26 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  33.08 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  189  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  32.1 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  27.41 
 
 		 374 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4667  hypothetical protein  38.12 
 
 		 227 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.976335  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  28.97 
 
 		 378 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  38.62 
 
 		 459 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  28.1 
 
 		 459 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  28.37 
 
 		 435 aa  95.5  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  41.18 
 
 		 478 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  29.41 
 
 		 465 aa  93.2  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  28.57 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  38.89 
 
 		 457 aa  87  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  28.81 
 
 		 428 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  30.59 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  25.93 
 
 		 527 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  36.43 
 
 		 466 aa  79.3  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  26.73 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.19 
 
 		 514 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0135  hypothetical protein  49.43 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.203  normal  0.0435696 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  32.84 
 
 		 464 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  31.29 
 
 		 595 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  30.43 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  24.14 
 
 		 617 aa  66.2  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  31.3 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.38 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  25.31 
 
 		 483 aa  62.4  0.00000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  30.07 
 
 		 555 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  33.33 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  26.32 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3860  ATPase-like  22.77 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.247695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  25.6 
 
 		 365 aa  55.5  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1751  hypothetical protein  32.05 
 
 		 513 aa  53.5  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.03 
 
 		 393 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0640  hypothetical protein  37.1 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03481  recombination protein F  28.44 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0943  hypothetical protein  45.45 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000190881  hitchhiker  0.00360431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.7 
 
 		 615 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1487  hypothetical protein  32 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.10218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1310  hypothetical protein  33.87 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1281  hypothetical protein  33.87 
 
 		 460 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  24.41 
 
 		 378 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0794  ATP-dependent OLD family endonuclease  24.86 
 
 		 647 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  25.15 
 
 		 378 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  33.77 
 
 		 388 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  34.48 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  23.21 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4173  SMC domain-containing protein  22.1 
 
 		 583 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1441  hypothetical protein  34.72 
 
 		 307 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0532167  hitchhiker  0.00000885873 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0003  recombination protein F  29.55 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0323054 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2545  ATPase-like  46.94 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000977998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49480  hypothetical protein  24.36 
 
 		 595 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000071972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  40.32 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  35.29 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  50 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  32.58 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  40.32 
 
 		 390 aa  46.2  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  28.32 
 
 		 373 aa  46.2  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  24.27 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  22.61 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  44.68 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  34.83 
 
 		 478 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  38.71 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.22 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  44.9 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1988  hypothetical protein  38.55 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  46.81 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  44.68 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  44.9 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  44.68 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2912  SMC protein-like  31.73 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.492401  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0924  hypothetical protein  31.19 
 
 		 347 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.281728 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  53.06 
 
 		 522 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0895  hypothetical protein  30.36 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.295883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2832  SMC domain protein  51.16 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  36.51 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  25.47 
 
 		 368 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  40.32 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1204  hypothetical protein  23.51 
 
 		 567 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530833  normal  0.121521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  35.05 
 
 		 645 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4266  ATPase-like protein  46.67 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  43.9  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  46.81 
 
 		 390 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  31.43 
 
 		 584 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3222  DNA replication and repair protein RecF  28.07 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505165 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  20.92 
 
 		 395 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2377  hypothetical protein  36.7 
 
 		 581 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  42.59 
 
 		 356 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.44 
 
 		 677 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>