84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3515 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  100 
 
 		 152 aa  315  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  36.69 
 
 		 148 aa  97.4  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2439  hypothetical protein  34.65 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  40.7 
 
 		 417 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.93 
 
 		 206 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  37.93 
 
 		 206 aa  60.1  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  40 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  34.44 
 
 		 405 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  29.7 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  39.29 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  36.78 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.59 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  36.59 
 
 		 231 aa  57  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  36.47 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.47 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.63 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.63 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  34.44 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  37.35 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  36.78 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  36.78 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  36.78 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3544  TonB family protein  30.39 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.788669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.59 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  40 
 
 		 115 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  34.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.94 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  34.94 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.47 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  33.73 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  40.68 
 
 		 403 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  36.05 
 
 		 204 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.59 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  37.29 
 
 		 207 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  29.63 
 
 		 390 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  38.1 
 
 		 367 aa  51.2  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  28.57 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  32.53 
 
 		 219 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  35.59 
 
 		 217 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  35.29 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  38.98 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.48 
 
 		 404 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  29.79 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  25.88 
 
 		 391 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  28.89 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.2 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  26.72 
 
 		 413 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.75 
 
 		 237 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  33.93 
 
 		 371 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  33.93 
 
 		 371 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  32 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  30.99 
 
 		 260 aa  45.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  30.49 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0623  TonB family protein  31.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.480841  normal  0.103893 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  26.97 
 
 		 319 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  31.76 
 
 		 363 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  30.23 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  32.39 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  30.95 
 
 		 349 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  30.23 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2645  TonB domain-containing protein  27.14 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  33.33 
 
 		 342 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1642  TonB family protein  22 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  31.25 
 
 		 138 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  29.59 
 
 		 305 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  34.62 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  28.57 
 
 		 275 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  33.93 
 
 		 334 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  28.57 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  29.87 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  37.88 
 
 		 264 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  37.88 
 
 		 270 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.35 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  26.51 
 
 		 277 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  29.11 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  28.57 
 
 		 286 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  36.36 
 
 		 361 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  24.59 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  26.92 
 
 		 218 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  35.59 
 
 		 223 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  29.87 
 
 		 277 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>