68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1642 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1642  TonB family protein  100 
 
 		 145 aa  301  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  51.61 
 
 		 147 aa  147  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3544  TonB family protein  48.8 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.788669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.38 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  32.93 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2467  hypothetical protein  46.94 
 
 		 50 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.18408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  27.84 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  27.84 
 
 		 203 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  27.85 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  32.11 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2645  TonB domain-containing protein  23.36 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.399197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  30.67 
 
 		 205 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  30.67 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  26.03 
 
 		 391 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  30 
 
 		 249 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  26.8 
 
 		 203 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  26.8 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  31.58 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  31.58 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1889  hypothetical protein  26.67 
 
 		 462 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  30.36 
 
 		 206 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2868  hypothetical protein  28.12 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  28.33 
 
 		 251 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27 
 
 		 405 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  28.33 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.25 
 
 		 404 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3515  TonB family protein  22 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0209136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  29.31 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  26.67 
 
 		 264 aa  42  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  30.36 
 
 		 203 aa  42  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.14 
 
 		 206 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  32.79 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  31.15 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  25.32 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  32.79 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  32.79 
 
 		 242 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  32.79 
 
 		 240 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  31.15 
 
 		 239 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  32.79 
 
 		 240 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  31.15 
 
 		 244 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  27.54 
 
 		 204 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  26.67 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  25 
 
 		 239 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  26.67 
 
 		 207 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  25 
 
 		 238 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  31.15 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  30.49 
 
 		 349 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  22.83 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  28 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  31.15 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  31.15 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  31.15 
 
 		 244 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  28 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  31.15 
 
 		 239 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  26.32 
 
 		 223 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  28.07 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  26.73 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  30.36 
 
 		 206 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  28 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  30.51 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  33.33 
 
 		 396 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  25.33 
 
 		 207 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>