More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17340 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  387  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  77.22 
 
 		 183 aa  300  7.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  42.13 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  38.12 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  36.72 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  38.8 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  39.56 
 
 		 184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  37.7 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  36.26 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 184 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  35.03 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  35.52 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  33.71 
 
 		 184 aa  118  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  35.96 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  32.8 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  30.43 
 
 		 193 aa  101  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  29.12 
 
 		 194 aa  88.2  7e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  31.84 
 
 		 503 aa  74.7  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4110  XRE family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.595211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.34 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2356  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.190302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1668  transcriptional regulator, XRE family  24.86 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  27.93 
 
 		 190 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  26.82 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2038  transcriptional regulator  25 
 
 		 230 aa  67.8  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.547476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  25.14 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  25.28 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  25 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  24 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  22.1 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  24.57 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  25.14 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2858  transcriptional regulator, XRE family  23.76 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000622832  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  26.26 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1507  transcriptional regulator, XRE family  21.47 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 234 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  25.4 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 180 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  24.46 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  25.7 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  27.84 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  23.08 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1558  cupin 2 domain-containing protein  25.44 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  25.28 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  29.21 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  24.31 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  26.79 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4784  transcriptional regulator, XRE family  25.14 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0510271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>