More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_01810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01810  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1693  ABC transporter related  52.63 
 
 		 232 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  50.22 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.84 
 
 		 233 aa  247  9e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1583  ABC transporter related  48.48 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  43.35 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  45.89 
 
 		 233 aa  235  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  44.59 
 
 		 233 aa  231  9e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2874  ABC transporter related  46.61 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.675054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1421  ABC transporter related  46.52 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  45.78 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  48.7 
 
 		 254 aa  224  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0745  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0728  ABC transporter, ATP-binding protein  43.29 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1715  ATPase  44.02 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1212  ABC transporter related  45.65 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00777209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  44.21 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1279  ABC transporter related  44.78 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2302  ABC transporter related  45.73 
 
 		 243 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  45.22 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  45.26 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  44.07 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  47.98 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0132  ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 		 233 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1125  ATPase  43.04 
 
 		 245 aa  214  7e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.237557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  43.86 
 
 		 245 aa  213  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  43.86 
 
 		 235 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1479  ABC transporter related  46.02 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1081  peptide ABC transporter ATPase  41.53 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01920  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  45.74 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1205  peptide ABC transporter ATPase  46.51 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  43.95 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  45.18 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 		 244 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1583  ABC transporter ATPase  45.96 
 
 		 241 aa  210  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.929196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4369  ABC transporter related  45.61 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4501  ABC transporter related  45.61 
 
 		 234 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.293779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  44.25 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  45.33 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1479  ABC transporter-related protein  42.61 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  44.35 
 
 		 235 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  44.69 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.11 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0324  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 235 aa  205  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2206  ABC transporter related  43.11 
 
 		 251 aa  204  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.661126  normal  0.0101904 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  40.68 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5377  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.409003 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0062  ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.857763  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  41.13 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2064  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.325549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1013  ABC transporter related  43.42 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  42.17 
 
 		 239 aa  201  7e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3583  ABC transporter related  44.71 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00659829  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6252  ABC transporter related  44.3 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.946819  normal  0.438945 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3436  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 		 245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165594  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1056  ABC transporter related  43.72 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  43.5 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  41.98 
 
 		 604 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0216  hypothetical protein  43.04 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  41.7 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0021  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 345 aa  196  3e-49  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  42.6 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  45.87 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1145  ABC transporter related  41.59 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  42.98 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0302  ABC transporter related  43.91 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  45.83 
 
 		 230 aa  191  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  41.07 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  42.2 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5173  ABC transporter related  42.11 
 
 		 238 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2521  ABC transporter related  44.84 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  40.83 
 
 		 248 aa  187  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  45.37 
 
 		 231 aa  187  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  44.55 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1775  ABC transporter related  41.44 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  39.46 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  44.04 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  42.13 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 		 231 aa  184  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0793  ABC transporter related protein  42.24 
 
 		 229 aa  184  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  43.52 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  41.33 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  40.17 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  42.34 
 
 		 664 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  40.87 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1404  ABC transporter related  45.45 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  42.41 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  42.99 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1457  ABC transporter related  44.95 
 
 		 228 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1757  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 235 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.245254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  41.23 
 
 		 252 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  41.67 
 
 		 232 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03342  ABC transporter ATP-binding protein  42.22 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>