More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2382 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  79.44 
 
 		 1083 aa  1698    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  80.15 
 
 		 1091 aa  1718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  79.79 
 
 		 1087 aa  1701    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  78.77 
 
 		 1082 aa  1706    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  79.24 
 
 		 1086 aa  1721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  42.55 
 
 		 1166 aa  771    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  81.38 
 
 		 1085 aa  1723    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  37.07 
 
 		 1050 aa  670    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1043 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  81.48 
 
 		 1085 aa  1725    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 		 1044 aa  643    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  82.34 
 
 		 1095 aa  1763    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  81.38 
 
 		 1085 aa  1724    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  44.42 
 
 		 1173 aa  919    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  78.05 
 
 		 1102 aa  1696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  41.24 
 
 		 1213 aa  730    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  54.06 
 
 		 1156 aa  1098    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  74.63 
 
 		 1081 aa  1600    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  80.87 
 
 		 1087 aa  1729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  80.78 
 
 		 1087 aa  1728    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  53.06 
 
 		 1122 aa  1105    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1083 aa  2176    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1034 aa  650    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  81.05 
 
 		 1087 aa  1732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  81.38 
 
 		 1085 aa  1724    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  37.03 
 
 		 1044 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 1040 aa  612  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1043 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1046 aa  586  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1011 aa  589  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1034 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1027 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1055 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1017 aa  539  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1050 aa  532  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1038 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1044 aa  523  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1027 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.42 
 
 		 1049 aa  516  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1058 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1028 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1032 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1470 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1045 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1041 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1038 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.3 
 
 		 1496 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1044 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1041 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1071 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1028 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1028 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.02 
 
 		 1024 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1039 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1053 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.54 
 
 		 1024 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.73 
 
 		 1036 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1069 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1087 aa  456  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1039 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1095 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1101 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1034 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1070 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1028 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.95 
 
 		 1050 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.42 
 
 		 1040 aa  445  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  29.66 
 
 		 1071 aa  440  9.999999999999999e-123  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  29.28 
 
 		 1092 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1006 aa  440  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1048 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1036 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1171 aa  442  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1177 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1031 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1051 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1031 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1031 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1070 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1057 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1029 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1031 aa  436  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1088 aa  435  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1028 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1026 aa  436  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1058 aa  436  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.28 
 
 		 1031 aa  430  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1042 aa  430  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1048 aa  432  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1073 aa  432  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1033 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1075 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1009 aa  427  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1030 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 		 1065 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1031 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1054 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>