158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3339 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3339  methylation  100 
 
 		 157 aa  320  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000729468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4104  MSHA pilin protein MshC  57.5 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0517  MSHA pilin protein MshC  53.75 
 
 		 162 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.426127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3827  methylation site containing protein  53.75 
 
 		 162 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000859994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3653  methylation site containing protein  55.84 
 
 		 162 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0474  methylation site containing protein  55.19 
 
 		 162 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00105235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3477  methylation site containing protein  55.19 
 
 		 162 aa  166  9e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0513  methylation site containing protein  52.5 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00478235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0492  methylation site containing protein  52.15 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00337293  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0569  MSHA pilin protein MshC  55.97 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3759  MSHA pilin protein MshC  49.68 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00178977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4407  MSHA pilin protein MshC  47.13 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0553  MSHA pilin protein MshC  48.03 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00995446  normal  0.374252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0462  MSHA pilin protein MshC  49.69 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.551025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3743  methylation site containing protein  48 
 
 		 159 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160506  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0398  MSHA pilin protein MshC  43.87 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556071  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4568  MSHA pilin protein MshC  33.92 
 
 		 182 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.116926  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0178  prepilin-type cleavage/methylation  37.14 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2828  MSHA pilin protein MshC  34.76 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00259  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshC (pilus type IV)  34.88 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0392  hypothetical protein  44.07 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497888  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3267  hypothetical protein  36.14 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347086  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0573  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  70.97 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.200044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0755  general secretion pathway protein H  33.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3760  methylation site containing protein  67.74 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000143336  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3266  methylation site containing protein  42.86 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1176  hypothetical protein  41.38 
 
 		 163 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3989  pilin, putative  64.52 
 
 		 187 aa  48.5  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.387559 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0552  MSHA pilin protein MshA  67.74 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00386307  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3478  methylation site containing protein  67.74 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000141512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0516  methylation site containing protein  67.74 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00623258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0551  MSHA pilin protein MshA  64.52 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000258454  normal  0.542221 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0397  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 163 aa  47.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.061774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0396  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0195536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1101  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 167 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000943511 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3444  methylation site containing protein  44.23 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2001  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3296  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 173 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4410  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 175 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000246782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3308  methylation site containing protein  41.07 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0567  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0512  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000175657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3479  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000294883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0473  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3744  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.144711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3656  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00406084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002375  MSHA pilin protein MshA  61.29 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0138724  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0461  MSHA pilin protein MshA  64.52 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3315  pilin, putative  65.52 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.540059  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3074  pilin, putative  64.52 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4105  MSHA pilin protein MshA  64.52 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3821  hypothetical protein  38.18 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0478  type IV pilus, prepilin-like protein (MSHC)  23.76 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.993627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3828  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000112537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0515  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000372661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4409  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000123074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2827  MSHA pilin protein MshA  61.29 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.99325  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0491  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000497616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03692  hypothetical protein  61.29 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1142  cellulose binding, type IV  38.6 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0476  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  58.06 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0364  MshA, mannose-sensitive haemaglutinin  48.15 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0735599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0395  methylation site containing protein  57.58 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0635812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0568  methylation site containing protein  64.52 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3326  pilin, putative  65.62 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0266287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.66 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3689  pilin, putative  61.29 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1066  pilin, putative  57.5 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00196226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0477  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin A  58.06 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0999  methylation site containing protein  41.82 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0926979  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1064  methylation site containing protein  41.82 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.691522  normal  0.0588159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1003  methylation site containing protein  41.82 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102399 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1141  V10 pilin  58.06 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0964  pilin, putative  57.5 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0885526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1033  pilin, putative  57.5 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0234716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3761  MSHA pilin protein MshA  65.52 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000202365  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0708  methylation site containing protein  43.48 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0386199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  47.17 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0842  hypothetical protein  65.52 
 
 		 193 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4569  MSHA pilin protein MshA  67.86 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3340  methylation  61.29 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000827612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0976  pilin, putative  64.29 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0485556  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3690  methylation site containing protein  74.07 
 
 		 185 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3217  hypothetical protein  70.37 
 
 		 108 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000170582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  29.92 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0856  methylation site containing protein  60 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4408  MSHA pilin protein MshA  35.29 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00456827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1036  hypothetical protein  39.58 
 
 		 131 aa  43.9  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3781  hypothetical protein  62.07 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0883  general secretion pathway protein H  60.71 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0109332  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3341  methylation  36.36 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  45.1 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1141  MSHA pilin protein MshB  51.61 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3520  methylation site containing protein  70.37 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0435  methylation site containing protein  73.08 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2151  membrane protein  54.84 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3983  methylation site containing protein  36 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00258  MSHA pilin protein MshA  54.84 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>