123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3187 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3187  exonuclease VII, small subunit  100 
 
 		 1380 aa  2809    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4467  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1271 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00502079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4158  hypothetical protein  24.71 
 
 		 1271 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  24.58 
 
 		 1273 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0843  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1267 aa  359  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.560634  normal  0.938035 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12700  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1277 aa  356  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58090  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1276 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5090  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1275 aa  348  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.340947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0938  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1273 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0978  hypothetical protein  23.88 
 
 		 1271 aa  336  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0945  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1271 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4277  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1269 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2235  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1290 aa  217  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0488  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1287 aa  199  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.135683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3682  hypothetical protein  21.04 
 
 		 1265 aa  181  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3561  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1266 aa  180  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3560  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1266 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3632  hypothetical protein  22 
 
 		 1266 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.357405  normal  0.0273308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3667  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1266 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3729  hypothetical protein  21.69 
 
 		 1266 aa  177  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.424475  normal  0.178844 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03105  conserved membrane protein, predicted transporter  20.41 
 
 		 1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0723003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03056  hypothetical protein  20.41 
 
 		 1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.102838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4562  hypothetical protein  20.54 
 
 		 1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0190737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1744  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1284 aa  175  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0306491 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3541  hypothetical protein  20.43 
 
 		 1266 aa  172  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4397  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1392 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.963583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002388  possible exported protein  20.62 
 
 		 1301 aa  167  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.267234  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3435  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1266 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0461  hypothetical protein  20.55 
 
 		 1266 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00853598  normal  0.775435 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0380  hypothetical protein  22.4 
 
 		 1265 aa  157  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1719  hypothetical protein  19.54 
 
 		 1273 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  19.42 
 
 		 1441 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2723  membrane protein-like  27.98 
 
 		 1236 aa  155  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.439608  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  19.38 
 
 		 1446 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1719  hypothetical protein  19.52 
 
 		 1273 aa  153  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03680  hypothetical protein  20.52 
 
 		 1266 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0408  hypothetical protein  19.47 
 
 		 1436 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3733  hypothetical protein  19.36 
 
 		 1443 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3329  hypothetical protein  19.71 
 
 		 1419 aa  141  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3643  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1417 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2136  hypothetical protein  23.22 
 
 		 1141 aa  137  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  19.18 
 
 		 1454 aa  135  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3467  hypothetical protein  20.44 
 
 		 1416 aa  134  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  20.65 
 
 		 1283 aa  133  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  19.47 
 
 		 1459 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  19.49 
 
 		 1383 aa  132  6e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0484  hypothetical protein  19.83 
 
 		 1417 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.814446 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2839  hypothetical protein  21.23 
 
 		 1291 aa  131  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0411  hypothetical protein  22.51 
 
 		 1274 aa  130  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.68904  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2656  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1288 aa  129  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.37084  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0461  conserved hypothetical protein  21.06 
 
 		 1266 aa  128  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.049997  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1384 aa  128  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3728  hypothetical protein  21.02 
 
 		 1266 aa  127  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2507  hypothetical protein  20.71 
 
 		 1419 aa  128  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.380036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2657  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1426 aa  127  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1398 aa  125  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3277  hypothetical protein  20.69 
 
 		 1266 aa  125  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.682788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1988  membrane protein-like protein  19.9 
 
 		 1300 aa  124  9e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0366  hypothetical protein  21.7 
 
 		 1381 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0471  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1286 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.356031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1390 aa  123  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0188  hypothetical protein  18.91 
 
 		 1301 aa  123  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1942  membrane protein-like protein  24.12 
 
 		 1272 aa  123  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.307785  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  18.67 
 
 		 1323 aa  121  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00269  putative protease  20.05 
 
 		 1331 aa  120  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4831  hypothetical protein  20.92 
 
 		 1420 aa  119  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761382  normal  0.626491 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2488  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1426 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2894  putative transmembrane protein  22.38 
 
 		 1426 aa  116  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3830  hypothetical protein  20.88 
 
 		 1284 aa  112  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.238588  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  19.44 
 
 		 1294 aa  111  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4656  hypothetical protein  20.79 
 
 		 1425 aa  111  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3897  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1379 aa  110  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.663381 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4406  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1291 aa  108  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.213897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0410  hypothetical protein  22.18 
 
 		 1309 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.103346 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01889  hypothetical protein  21.31 
 
 		 1306 aa  107  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0257  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1276 aa  106  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  28.44 
 
 		 1304 aa  103  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1430 aa  102  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0472  membrane protein  20.48 
 
 		 1515 aa  101  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3672  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1277 aa  97.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  20.35 
 
 		 1384 aa  97.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1057  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1264 aa  96.7  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  20.49 
 
 		 1428 aa  95.1  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0403  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1305 aa  95.1  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1341 aa  94.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0512  hypothetical protein  19.24 
 
 		 1153 aa  93.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.350168  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1645  hypothetical protein  19.24 
 
 		 1153 aa  93.2  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000756943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3330  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1307 aa  92.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000315008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0470  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1307 aa  92.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.196897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1193  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1307 aa  92  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.879408  hitchhiker  0.00193389 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0268  hypothetical protein  23.84 
 
 		 1276 aa  90.9  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0563  hypothetical protein  19.39 
 
 		 1419 aa  90.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72639  normal  0.280407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1029  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1419 aa  89  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3368  hypothetical protein  21.96 
 
 		 1378 aa  87.8  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48731  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  28.12 
 
 		 1261 aa  87.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  21.54 
 
 		 1397 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1368 aa  83.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1397 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1397 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  21.44 
 
 		 1397 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>