More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3220 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 539 aa  1074    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0243326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0622  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  69.2 
 
 		 539 aa  716    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.321986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  67.53 
 
 		 539 aa  707    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  67.9 
 
 		 539 aa  688    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.07 
 
 		 539 aa  1066    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.417897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3067  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.07 
 
 		 539 aa  1064    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0971462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  32.54 
 
 		 539 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 		 547 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0143  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 539 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.797541  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 541 aa  213  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 		 637 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.81 
 
 		 645 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.57 
 
 		 645 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 		 636 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1600  chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 538 aa  203  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00759873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.75 
 
 		 552 aa  202  9e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  38.08 
 
 		 712 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  38.37 
 
 		 712 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  38.66 
 
 		 713 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  36.8 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.13 
 
 		 716 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.01 
 
 		 638 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 		 634 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 637 aa  196  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.91 
 
 		 643 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.24 
 
 		 634 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.15 
 
 		 552 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2823  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.13 
 
 		 550 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  34.26 
 
 		 545 aa  194  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 		 638 aa  193  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.26 
 
 		 620 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.42 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.82 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 548 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.06 
 
 		 638 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 		 639 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.61 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 		 548 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  33.62 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.55 
 
 		 636 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.59 
 
 		 605 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000515244  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2220  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  34.56 
 
 		 646 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.071358  normal  0.520396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0657  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  33.71 
 
 		 648 aa  188  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 		 573 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.86 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 540 aa  188  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 		 548 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  188  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 		 544 aa  187  4e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 559 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.59 
 
 		 638 aa  186  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  34.63 
 
 		 545 aa  186  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  36.34 
 
 		 553 aa  187  6e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 		 632 aa  186  7e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 545 aa  186  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  34.28 
 
 		 646 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 		 568 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 		 636 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.2 
 
 		 572 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 		 499 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.09 
 
 		 547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 674 aa  183  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  36.7 
 
 		 545 aa  183  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 553 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 		 773 aa  183  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 620 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.403145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 544 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  40.13 
 
 		 634 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  37.26 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 		 647 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.99 
 
 		 647 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 		 557 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.49 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.72 
 
 		 630 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.53 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  36.53 
 
 		 561 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.2 
 
 		 640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1957  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 664 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.257458  normal  0.211978 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1929  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.38 
 
 		 662 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.0188929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2369  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.34 
 
 		 664 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0315396  normal  0.0961625 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 664 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0377955  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 647 aa  181  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.88 
 
 		 620 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 648 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  36.22 
 
 		 561 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 621 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>