More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3395 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3395  tryptophan synthase subunit alpha  100 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.400111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3170  tryptophan synthase subunit alpha  91.73 
 
 		 267 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2873  tryptophan synthase, alpha subunit  62.78 
 
 		 273 aa  325  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000898556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2511  tryptophan synthase subunit alpha  67.19 
 
 		 266 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3025  tryptophan synthase subunit alpha  65.92 
 
 		 274 aa  314  9e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3049  tryptophan synthase subunit alpha  62.74 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3108  tryptophan synthase subunit alpha  62.74 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3065  tryptophan synthase subunit alpha  62.36 
 
 		 262 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.230237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2818  tryptophan synthase subunit alpha  61.6 
 
 		 262 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0466894  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1452  tryptophan synthase subunit alpha  60.84 
 
 		 263 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1075  tryptophan synthase subunit alpha  63.64 
 
 		 267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00681111  normal  0.362722 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11629  tryptophan synthase subunit alpha  64.12 
 
 		 270 aa  305  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.451087  normal  0.171267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5700  tryptophan synthase, alpha subunit  61.22 
 
 		 261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3598  tryptophan synthase subunit alpha  59.32 
 
 		 262 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5709  tryptophan synthase, alpha subunit  58.94 
 
 		 269 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2946  tryptophan synthase, alpha subunit  58.02 
 
 		 275 aa  294  9e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219173  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28090  tryptophan synthase, alpha chain  58.05 
 
 		 261 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.414485  normal  0.593742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1984  tryptophan synthase, alpha subunit  65.32 
 
 		 278 aa  291  7e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1933  tryptophan synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 306 aa  291  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0945719  normal  0.868829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2941  tryptophan synthase, alpha chain  59.32 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0528933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3015  tryptophan synthase subunit alpha  61.34 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20730  tryptophan synthase, alpha chain  58.11 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.177097  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3173  tryptophan synthase, alpha subunit  60.64 
 
 		 272 aa  275  6e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.393715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2964  tryptophan synthase, alpha subunit  56.92 
 
 		 276 aa  264  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.148492  normal  0.771693 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1684  tryptophan synthase subunit alpha  54.2 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000282311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3074  tryptophan synthase, alpha subunit  59.65 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000185478  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1501  tryptophan synthase, alpha subunit  57.03 
 
 		 276 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1166  tryptophan synthase, alpha chain  59.39 
 
 		 270 aa  257  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2055  tryptophan synthase, alpha subunit  55.13 
 
 		 260 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.270765  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1217  tryptophan synthase, alpha subunit  54.55 
 
 		 274 aa  255  7e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.923189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14910  tryptophan synthase, alpha chain  54.94 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.451754  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3215  tryptophan synthase, alpha subunit  62.64 
 
 		 265 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1689  tryptophan synthase subunit alpha  52.67 
 
 		 272 aa  251  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.834994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0482  tryptophan synthase subunit alpha  51.33 
 
 		 289 aa  248  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0647484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2219  tryptophan synthase, alpha subunit  57.25 
 
 		 269 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10980  tryptophan synthase subunit alpha  52.02 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0662937  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12900  tryptophan synthase, alpha chain  54.55 
 
 		 292 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0777169  normal  0.0541749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2950  tryptophan synthase subunit alpha  42.62 
 
 		 261 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1248  tryptophan synthase, alpha subunit  37.93 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1160  tryptophan synthase, alpha chain  43.9 
 
 		 261 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1948  tryptophan synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 261 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1693  tryptophan synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000483828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3623  tryptophan synthase subunit alpha  40.23 
 
 		 263 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1488  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1278  tryptophan synthase subunit alpha  39.92 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1667  tryptophan synthase, alpha subunit  43.8 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000552376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2593  tryptophan synthase subunit alpha  41.13 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2273  tryptophan synthase subunit alpha  35.98 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.062461 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3240  tryptophan synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1863  tryptophan synthase subunit alpha  34.62 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4745  tryptophan synthase subunit alpha  37.12 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2241  tryptophan synthase subunit alpha  39.51 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1156  tryptophan synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0037  tryptophan synthase subunit alpha  38.72 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1839  tryptophan synthase, alpha subunit  42.91 
 
 		 263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.262637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2808  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1258  tryptophan synthase alpha chain  41.77 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1336  tryptophan synthase, alpha chain  40.93 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.800538  normal  0.338258 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1214  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0210268 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69669  tryptophan synthetase  36.26 
 
 		 700 aa  172  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.390453  normal  0.887683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3047  tryptophan synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 272 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.87 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2135  tryptophan synthase subunit alpha  40.57 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.192647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2371  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 264 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0243163  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1512  tryptophan synthase subunit alpha  43.64 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49484  predicted protein  37.12 
 
 		 302 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000433927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1021  tryptophan synthase  38.35 
 
 		 271 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00440  tryptophan synthase subunit alpha  38.35 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.203151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1811  tryptophan synthase subunit alpha  39.75 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.513104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0082  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.49464  hitchhiker  0.00038137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3617  tryptophan synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 272 aa  168  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0097  tryptophan synthase subunit alpha  38.11 
 
 		 269 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224366 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2082  tryptophan synthase subunit alpha  37.45 
 
 		 266 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116682  hitchhiker  0.0000211332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1787  tryptophan synthase subunit alpha  39.62 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3219  tryptophan synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5244  tryptophan synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 269 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0952  tryptophan synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06231  Bifunctional tryptophan synthase TRPB (EC 4.2.1.20) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P4D5]  34.75 
 
 		 723 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3428  tryptophan synthase, alpha chain  42.92 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1697  tryptophan synthase, alpha chain  37.5 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0895  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76e-31 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0100  tryptophan synthase subunit alpha  37.36 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.882504  hitchhiker  0.000187613 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1207  tryptophan synthase, alpha subunit  34.85 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1621  tryptophan synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 278 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0411  tryptophan synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1025  tryptophan synthase subunit alpha  40.66 
 
 		 266 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.201546  hitchhiker  0.000106385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1262  tryptophan synthase, alpha chain  38.89 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2494  tryptophan synthase, alpha subunit  39.27 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1518  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.396024  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1269  tryptophan synthase subunit alpha  37.04 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1490  tryptophan synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1981  tryptophan synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0328382 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1048  tryptophan synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 265 aa  165  8e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.477219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0831  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2489  tryptophan synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0709214  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1414  tryptophan synthase subunit alpha  39.33 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0033  tryptophan synthase subunit alpha  37.59 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3350  tryptophan synthase subunit alpha  40.17 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.282051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1162  tryptophan synthase subunit alpha  38.08 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0070  tryptophan synthase subunit alpha  39.25 
 
 		 269 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>