More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0772 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 353 aa  701    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  28.94 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3727  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.39 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00335506  normal  0.0890337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  26.98 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.5 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  25.62 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 413 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3837  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmvB  29.57 
 
 		 405 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  26.69 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1427  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  26.73 
 
 		 484 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0791  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.79 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.83 
 
 		 538 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1613  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.8 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 537 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3502  secretion protein HlyD  28.52 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0531156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  24.17 
 
 		 402 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  29.1 
 
 		 683 aa  99.8  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.39 
 
 		 377 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02033  Secretion protein HlyD  28.48 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.31595  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  24.5 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1112  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 383 aa  99.4  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.941  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 416 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1297  RND family efflux transporter MFP subunit  25.66 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  25.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.21 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.96 
 
 		 422 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.37 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  25.74 
 
 		 416 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0686  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.5 
 
 		 380 aa  97.4  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268178 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0503  secretion protein HlyD  26.79 
 
 		 390 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1419  secretion protein HlyD  25.37 
 
 		 400 aa  96.3  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  28.01 
 
 		 538 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2432  HlyD family secretion protein  24.84 
 
 		 488 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1328  secretion protein HlyD  24.38 
 
 		 503 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.918511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  24.39 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  27.9 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2567  secretion protein HlyD  25.29 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.484116 
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  25.78 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  24.76 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  25.08 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.28 
 
 		 459 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  29.29 
 
 		 715 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  24.19 
 
 		 424 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  25.08 
 
 		 404 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  26.44 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  23.96 
 
 		 384 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.01 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3844  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.957975 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2746  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 366 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3678  RND family efflux transporter MFP subunit  24.51 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.235354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4685  secretion protein HlyD  24.51 
 
 		 489 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.44 
 
 		 546 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6171  RND family efflux transporter MFP subunit  24.18 
 
 		 491 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.442702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  23.78 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3518  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.93 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 500 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  24.93 
 
 		 384 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  23.75 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  26.52 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.35 
 
 		 510 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.034543  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01965  Secretion protein HlyD  26.76 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.303602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.8 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 		 361 aa  87.4  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 486 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.96 
 
 		 519 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  26.23 
 
 		 397 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  25.84 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3399  RND family efflux transporter MFP subunit  27.37 
 
 		 582 aa  86.3  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.68 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  27.02 
 
 		 561 aa  85.9  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.91 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.35 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.08 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  28.25 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 537 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  26.54 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1301  RND family efflux transporter MFP subunit  26.32 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.837432  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5032  copper and silver tricomponent efflux membrane fusion protein CusB (CzcB-like)  26.12 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.88 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  27.49 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  26.37 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>