More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0545 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0545  prophage LambdaSa1, site-specific recombinase phage integrase family protein  100 
 
 		 359 aa  738    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000831336  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  30.3 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  32.65 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1148  phage integrase family protein  29.54 
 
 		 376 aa  149  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000721683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1020  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.085573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1039  phage integrase family protein  30.86 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.1908  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  29.5 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1417  integrase  28.57 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.542507  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  27.24 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  24.59 
 
 		 385 aa  87  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  27.84 
 
 		 388 aa  86.7  6e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  27.04 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  27.18 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25.83 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  25.16 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  24.91 
 
 		 371 aa  79.3  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  27.78 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.51 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  27.16 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  25.36 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  21.74 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  27.27 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.64 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  24.92 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.92 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  21.68 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  25 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  23.89 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.21 
 
 		 356 aa  73.2  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0966  integrase family protein  24.53 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  25.08 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.44 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 402 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.44 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  26.7 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  25.91 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  24 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  24 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  22.55 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  22.89 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  22.89 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0795  integrase family protein  28.37 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.475603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  26.93 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1986  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 375 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  23.4 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03080  site-specific recombinase XerC  23.51 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0299404  hitchhiker  1.02879e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  23.19 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1973  integrase family protein  23.62 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0126366 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  25.08 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28710  site-specific recombinase XerD  22.38 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.870092  normal  0.942592 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  28.16 
 
 		 401 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  27.09 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  22.57 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25.89 
 
 		 389 aa  67.8  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.78 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  20.96 
 
 		 391 aa  67  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  25.1 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1690  integrase  25.58 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.34 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  23.17 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  29.03 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.89 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2112  phage integrase family site specific recombinase  26.38 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.19 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  24.31 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  24.29 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.6 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0135  bacteriophage-related integrase  23.95 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.566608  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  26.72 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  28 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2121  Phage integrase  27.17 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  22.4 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.58 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  23.73 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  25.56 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.94 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0956  site-specific recombinase, phage integrase family  30.6 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1795  Integrase  24.83 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  30.82 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  20.76 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  22.76 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  22.76 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  23.25 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.21 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  20.19 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  27.24 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  20.85 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  20.54 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  22.57 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1607  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  24.92 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>