141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1518 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 306 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  32.17 
 
 		 332 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  26.64 
 
 		 325 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  29.39 
 
 		 329 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  27.01 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  29.83 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  29.77 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  33.59 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  32.49 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  30.58 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  28.39 
 
 		 315 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  25.5 
 
 		 334 aa  97.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  25.91 
 
 		 323 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 342 aa  96.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 334 aa  92.8  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  25 
 
 		 338 aa  90.5  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  28.75 
 
 		 324 aa  89.7  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.83 
 
 		 337 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.62 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  28.22 
 
 		 332 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 336 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  31.53 
 
 		 330 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  24.54 
 
 		 336 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.83 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  26.98 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  30.3 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.88 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  26.64 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  25.68 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  27.27 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  28.28 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  30.65 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  28.85 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  30.15 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.77 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  29.5 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.62 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2834  DNA polymerase III, delta subunit  27.92 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  23.29 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  25.83 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  30.88 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  26.69 
 
 		 328 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.22 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2007  DNA polymerase III, delta subunit  26.77 
 
 		 336 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0773552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  17.37 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  22.88 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1819  DNA polymerase III subunit delta  21.77 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0075815  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1564  DNA polymerase III, delta subunit  24.9 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.32 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0761  DNA polymerase III subunit delta  23.37 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  26.95 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  32.84 
 
 		 312 aa  59.7  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  28.14 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5468  DNA polymerase III subunit delta  26.28 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.934031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  33 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  26.87 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0686  DNA polymerase III, delta subunit  29.7 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0871952  normal  0.189562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0212  DNA polymerase III subunit delta  31.71 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  30.37 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2524  DNA polymerase III, delta subunit  30.85 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3265  DNA polymerase III, delta subunit  26.82 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.544926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  26.79 
 
 		 329 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  25.49 
 
 		 346 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.72 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1096  DNA polymerase III subunit delta  29.24 
 
 		 343 aa  55.1  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1451  DNA polymerase III subunit delta  28.12 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0184698  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2746  DNA polymerase III, delta subunit  27.41 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  24.73 
 
 		 331 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3538  DNA polymerase III subunit delta  31.18 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.332998  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  20 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  26.13 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  26.13 
 
 		 345 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  26.13 
 
 		 351 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0828  DNA polymerase III delta  22.1 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  25.54 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.07 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  26.84 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1888  DNA polymerase III, delta subunit  27.24 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.879444  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0670  DNA polymerase III delta  24.26 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.840892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0699  DNA polymerase III delta  29.3 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000587672  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0762  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0806  DNA polymerase III subunit delta  28.12 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0689  DNA polymerase III subunit delta  27.93 
 
 		 343 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00596065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>