149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0267 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2428  CRISPR-associated helicase Cas3  47.61 
 
 		 858 aa  691    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0267  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  100 
 
 		 821 aa  1631    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0975  CRISPR-associated helicase Cas3  36.97 
 
 		 821 aa  368  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2323  CRISPR-associated helicase Cas3  34.37 
 
 		 778 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3204  CRISPR-associated helicase Cas3  30.57 
 
 		 800 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15220  CRISPR-associated helicase Cas3  27.69 
 
 		 822 aa  325  1e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.280278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0940  CRISPR-associated helicase Cas3  29.46 
 
 		 800 aa  324  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  32.36 
 
 		 807 aa  322  1.9999999999999998e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0621  CRISPR-associated helicase Cas3  30.37 
 
 		 784 aa  311  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1186  CRISPR-associated helicase Cas3  32.13 
 
 		 776 aa  297  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0641  CRISPR-associated helicase Cas3  33.74 
 
 		 804 aa  295  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.674824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4288  CRISPR-associated helicase Cas3  28.78 
 
 		 836 aa  282  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1070  CRISPR-associated helicase Cas3  27.42 
 
 		 772 aa  279  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.894632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0308  CRISPR-associated helicase Cas3  27.56 
 
 		 777 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0768  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.77 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0233  CRISPR-associated helicase Cas3  26.05 
 
 		 765 aa  258  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.995838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1451  putative helicase  30.43 
 
 		 864 aa  227  7e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1021  CRISPR-associated HD domain-containing protein  29.68 
 
 		 721 aa  225  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2836  putative helicase  31.33 
 
 		 856 aa  224  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0539  CRISPR-associated helicase Cas3  29.87 
 
 		 783 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2978  metal dependent phosphohydrolase  32.71 
 
 		 745 aa  204  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3651  CRISPR-associated helicase Cas3  27.23 
 
 		 801 aa  201  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2518  helicases-like protein  28.76 
 
 		 781 aa  200  7.999999999999999e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0850  hypothetical protein  30.96 
 
 		 834 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1879  CRISPR-associated helicase Cas3  30.28 
 
 		 730 aa  195  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0657  CRISPR-associated helicase Cas3  29.89 
 
 		 732 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3519  metal dependent phosphohydrolase  28.26 
 
 		 829 aa  185  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.102828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0601  metal dependent phosphohydrolase  29.62 
 
 		 745 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3970  metal dependent phosphohydrolase  30.73 
 
 		 792 aa  182  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0498  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.68 
 
 		 724 aa  179  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1626  metal dependent phosphohydrolase  29.87 
 
 		 782 aa  178  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.869451  normal  0.728835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1010  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.78 
 
 		 824 aa  177  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1002  metal dependent phosphohydrolase  25.45 
 
 		 731 aa  177  8e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  37.25 
 
 		 740 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1941  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  27.54 
 
 		 744 aa  175  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.557598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0475  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  30.1 
 
 		 717 aa  175  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1657  CRISPR-associated helicase Cas3  26.86 
 
 		 739 aa  174  7.999999999999999e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3341  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  30.41 
 
 		 751 aa  172  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127091  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02701  crispr-associated helicase Cas3 domain protein  28.11 
 
 		 722 aa  170  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0428162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4335  CRISPR-associated helicase Cas3  27 
 
 		 904 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0995159  decreased coverage  0.00193959 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  27.27 
 
 		 753 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.650204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31630  CRISPR-associated helicase Cas3  29.5 
 
 		 661 aa  165  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3901  CRISPR-associated helicase Cas3  27.88 
 
 		 825 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1489  metal dependent phosphohydrolase  32.26 
 
 		 1078 aa  164  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0565561 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1979  metal dependent phosphohydrolase  33.41 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000184282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1436  CRISPR-associated helicase Cas3  27.58 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1064  metal dependent phosphohydrolase  31.65 
 
 		 722 aa  160  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1290  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.07 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1161  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.86 
 
 		 794 aa  156  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.67 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0828  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.53 
 
 		 752 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1476  metal dependent phosphohydrolase  24.63 
 
 		 728 aa  154  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0102234  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1295  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.81 
 
 		 692 aa  153  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3329  putative helicase  27.14 
 
 		 939 aa  152  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3582  CRISPR-associated helicase Cas3  27.57 
 
 		 759 aa  150  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3385  CRISPR-associated protein Cas5  29.86 
 
 		 1084 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.335684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.85 
 
 		 880 aa  140  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00422902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0239  metal dependent phosphohydrolase  29.33 
 
 		 772 aa  136  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  24.27 
 
 		 651 aa  135  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3933  CRISPR-associated helicase Cas3  26.38 
 
 		 805 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2186  CRISPR-associated HD domain protein  26.87 
 
 		 729 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0794  helicase-like protein  27.08 
 
 		 747 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.850322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1805  hypothetical protein  25.39 
 
 		 794 aa  102  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1171  CRISPR-associated HD domain-containing protein  28.65 
 
 		 316 aa  95.5  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0396  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.42 
 
 		 792 aa  94  9e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.514257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3002  CRISPR-associated helicase Cas3  24.17 
 
 		 794 aa  91.3  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0663  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.27 
 
 		 738 aa  90.1  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.98376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  24.57 
 
 		 729 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  24.62 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  32.47 
 
 		 901 aa  79.7  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  25.81 
 
 		 762 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  28.12 
 
 		 899 aa  75.5  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3509  hypothetical protein  29.39 
 
 		 850 aa  75.1  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.30369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2442  hypothetical protein  29.89 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.71 
 
 		 737 aa  73.2  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  23.09 
 
 		 726 aa  73.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  24.89 
 
 		 888 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  24.88 
 
 		 1027 aa  72.4  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  25.17 
 
 		 888 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  24.89 
 
 		 888 aa  70.5  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  24.11 
 
 		 783 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  26.46 
 
 		 854 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.67 
 
 		 905 aa  69.3  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  28.74 
 
 		 885 aa  67  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  24.96 
 
 		 779 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  24.86 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  23.31 
 
 		 744 aa  65.5  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1141  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  26.12 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.607397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  23.03 
 
 		 750 aa  64.3  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  26.45 
 
 		 764 aa  63.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  24.51 
 
 		 736 aa  63.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  28.21 
 
 		 879 aa  63.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  22.57 
 
 		 804 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.66 
 
 		 741 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  25.39 
 
 		 781 aa  62.4  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  27.12 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  24.59 
 
 		 927 aa  62.4  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 		 750 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  25.85 
 
 		 837 aa  61.2  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  25.57 
 
 		 971 aa  60.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>