More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4302 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 477 aa  928    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  92.45 
 
 		 477 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  40.98 
 
 		 621 aa  269  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  41.19 
 
 		 621 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  39.59 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  40.71 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  39.53 
 
 		 541 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  34.22 
 
 		 502 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.36 
 
 		 608 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 586 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  31.96 
 
 		 502 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  32.73 
 
 		 533 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  31.23 
 
 		 501 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 587 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  30 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.14 
 
 		 586 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27 
 
 		 509 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.98 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  32.12 
 
 		 514 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  31.19 
 
 		 514 aa  93.6  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.76 
 
 		 517 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 663 aa  88.2  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  32.75 
 
 		 329 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  28.27 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000985853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.41 
 
 		 516 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.61 
 
 		 504 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  23.87 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.76 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.9 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  37.98 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  31.38 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 		 353 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  32.26 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0861  secretion protein HlyD  35.29 
 
 		 330 aa  72  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0209949  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 496 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2731  secretion protein HlyD family protein  31.33 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  29.2 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1267  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 355 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.16 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 388 aa  69.3  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1777  secretion protein HlyD family protein  33.48 
 
 		 320 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0865879  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  31.34 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  31.98 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4857  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  28.95 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  26.12 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  25.92 
 
 		 634 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.35 
 
 		 500 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  31.13 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  30.66 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  29.47 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 631 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0453  secretion protein HlyD family protein  30.37 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 		 333 aa  67  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  27.72 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  33.12 
 
 		 333 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 365 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  30 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  29.79 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  30.54 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  29.79 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.25 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1741  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.14 
 
 		 496 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  34.88 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  31.37 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.78 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.78 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  29.9 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  27.53 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  35.26 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  35.26 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  31.06 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.75 
 
 		 671 aa  63.9  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.65 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  33.77 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  30.1 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2100  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528355 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2909  multidrug resistance efflux pump  37.82 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.06 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  29.79 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1305  secretion protein HlyD  29.92 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.18 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>