More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0177 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  93.5 
 
 		 514 aa  879    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 514 aa  1017    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0460  hypothetical protein  39.01 
 
 		 513 aa  282  1e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4231  hypothetical protein  38.45 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  36.65 
 
 		 533 aa  253  6e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 		 533 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0790  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.65 
 
 		 521 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.86 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  25.21 
 
 		 641 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.09 
 
 		 501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 621 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3213  multidrug resistance efflux pump-like protein  28.73 
 
 		 502 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.81 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  28.86 
 
 		 621 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  29.18 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.97 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.59 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  24.66 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  28.35 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  30.38 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  28.54 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.54 
 
 		 586 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  25.34 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  29.9 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.86 
 
 		 490 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.05 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  23.67 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2104  secretion protein HlyD family protein  30.59 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  26.07 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.64 
 
 		 504 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.26 
 
 		 505 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 521 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.32 
 
 		 361 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  30.5 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.24 
 
 		 663 aa  70.5  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.69 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  28.12 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  28.06 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.15 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.17 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.26 
 
 		 509 aa  67  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  25.44 
 
 		 421 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  27.95 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.93 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.33 
 
 		 431 aa  66.6  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  30.54 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.17 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4302  secretion protein HlyD family protein  29.69 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.358477  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  29.56 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  24.15 
 
 		 631 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.4 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2611  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.58 
 
 		 549 aa  64.3  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  30.08 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  28.65 
 
 		 225 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.45 
 
 		 516 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  28.7 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.08 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.45 
 
 		 516 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1765  secretion protein HlyD family protein  31.18 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.43 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  24.43 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  26.22 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.96 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  28.24 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  28.22 
 
 		 367 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2001  secretion protein HlyD  28.86 
 
 		 375 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.167131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1186  RND family efflux transporter MFP subunit  31.1 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.425099  normal  0.0297054 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.18 
 
 		 421 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  30.83 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4169  secretion protein HlyD family protein  30.75 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00575947  hitchhiker  0.00428587 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  26.01 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  30.99 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  30.19 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1184  secretion protein HlyD  30.2 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.51 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.8 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1169  membrane-fusion protein  26.51 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0146013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  27.48 
 
 		 383 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0816  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 		 479 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1737  secretion protein HlyD  27.59 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000190652  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  26.29 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0382  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.410142  normal  0.745706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0627  RND family efflux transporter MFP subunit  26.13 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>