More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0212 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 536 aa  1020    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  33.83 
 
 		 622 aa  127  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  42.59 
 
 		 225 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.64 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  33.47 
 
 		 598 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  35.74 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.34 
 
 		 509 aa  100  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  29.89 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 380 aa  95.5  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.84 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  30.61 
 
 		 449 aa  90.5  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  25.84 
 
 		 521 aa  90.1  9e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.84 
 
 		 400 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.25 
 
 		 435 aa  87.4  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.53 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4357  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  23.4 
 
 		 514 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8343  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.22 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0177  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 514 aa  80.1  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.624945  normal  0.250507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  24.59 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  23.63 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.72 
 
 		 490 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  24.74 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  23.06 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.21 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  25.57 
 
 		 536 aa  73.6  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  21.33 
 
 		 411 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.34 
 
 		 487 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.75 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 537 aa  70.9  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  22.51 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  33.08 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 353 aa  70.1  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 538 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  20.64 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.25 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  36.36 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  41.23 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.49 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 415 aa  67  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  31.94 
 
 		 414 aa  67  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  28.09 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  28.3 
 
 		 371 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  28.98 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  24.07 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  28.98 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  31.79 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  29.94 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  25.79 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  25.16 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  25.16 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  27.67 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  25.16 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.56 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  22.64 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  25.31 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2064  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  23.83 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  30.74 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  28.57 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  30.13 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  25.18 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.93 
 
 		 370 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.93 
 
 		 370 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  21.19 
 
 		 431 aa  62  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.93 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  23.83 
 
 		 322 aa  60.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.95 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  33.65 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  24.53 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  22.63 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  22.26 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  22.63 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1312  RND efflux transporter  22.63 
 
 		 401 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000130358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15871  membrane fusion protein  27.54 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  21.05 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>