More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0535 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  38.55 
 
 		 641 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  38.65 
 
 		 517 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 504 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 621 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 502 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 509 aa  75.1  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.53 
 
 		 608 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  32.65 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 500 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  43.33 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  46.73 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  41.44 
 
 		 536 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  28.31 
 
 		 500 aa  67.8  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  40.34 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0871  secretion protein HlyD  37.93 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 409 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 489 aa  65.5  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.79 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.58 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2709  multidrug resistance efflux pump-like protein  37.25 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.13 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.34 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  48.78 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.13 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  48.78 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  36.97 
 
 		 569 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  30 
 
 		 390 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.68 
 
 		 505 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 411 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 407 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 392 aa  62  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 381 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  29.23 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  29.23 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0200  secretion protein HlyD  33.08 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.296844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.77 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 374 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  40.29 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  34.34 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  40.43 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  28.72 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0997151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.82 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  31.08 
 
 		 471 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  36.79 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 		 496 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 634 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.4 
 
 		 496 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 430 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.77 
 
 		 368 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  33.8 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  33.8 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  33.8 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  33.8 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  33.74 
 
 		 426 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  40.74 
 
 		 443 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  30.56 
 
 		 371 aa  58.5  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  41.44 
 
 		 358 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  34.04 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  34.86 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  30.6 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  30.47 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  50.72 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.64 
 
 		 430 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 455 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416467  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.74 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  31.97 
 
 		 418 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 395 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4067  RND family efflux transporter MFP subunit  49.12 
 
 		 621 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  31.4 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0188  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  37.93 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1685  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 455 aa  55.8  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  33.94 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  34.09 
 
 		 421 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.69 
 
 		 379 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.09 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  28.57 
 
 		 392 aa  55.1  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  42.35 
 
 		 368 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 387 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  38.52 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0971  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33 
 
 		 416 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3604  secretion protein HlyD  31.22 
 
 		 422 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105186  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  36.84 
 
 		 379 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 397 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 431 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  40.87 
 
 		 587 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 420 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 397 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>