More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4025 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 418 aa  845    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  52.22 
 
 		 419 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3980  secretion protein HlyD family protein  49.52 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0895  secretion protein HlyD family protein  45.99 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  42.82 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  42.02 
 
 		 426 aa  271  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  30.68 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  31.09 
 
 		 607 aa  186  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4096  secretion protein HlyD family protein  31.81 
 
 		 431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  28.87 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.35 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.82 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  23.17 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.67 
 
 		 505 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_003296  RS03081  ABC transporter ATP-binding protein  24.66 
 
 		 417 aa  77.8  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.955285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  23.81 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.34 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.12 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.42 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  25.91 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  25.14 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2991  hypothetical protein  19.11 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2851  hypothetical protein  19.77 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  22.36 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  21.73 
 
 		 407 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  23.69 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0039  macrolide-specific efflux protein  21.35 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.461256  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.35 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  22.29 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  26.01 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  20.71 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  23.32 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  24.8 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2468  secretion protein HlyD family protein  22.4 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  26.88 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.1 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  25.71 
 
 		 342 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.93 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  23.81 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  25.56 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  25.79 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  26.72 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  26.88 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  26.88 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  26.88 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1901  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  26.32 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1552  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  26.32 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1732  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  26.32 
 
 		 286 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0446824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1612  P-hydroxybenzoic acid efflux pump subunit AaeA  26.32 
 
 		 286 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.473839 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  26.88 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  26.88 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.96 
 
 		 286 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  24.57 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  24.21 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  20.79 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  25.21 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  23.48 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2293  secretion protein  25.3 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  19.56 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4889  HlyD family secretion protein  25.08 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.392756  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.91 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0659148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  21.84 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.04 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01614  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.880107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  23.89 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  24.65 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  24.65 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.07 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2356  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000721779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1836  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.182346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  23.87 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  20.07 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3120  multidrug resistance protein A  26.12 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0308659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  21.51 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  27.52 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.85 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01604  hypothetical protein  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.787651  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1855  MFP family transporter  24.65 
 
 		 285 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0284898  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  24.65 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3014  multidrug resistance protein A  25.75 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193784 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  24.2 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.85 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2962  multidrug resistance protein A  25.75 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.832708  hitchhiker  0.00715907 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2997  multidrug resistance protein A  25.75 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  23.18 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2931  multidrug resistance protein A  25.75 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  23.24 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>