More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3980 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3980  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 420 aa  836    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  63.76 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  49.52 
 
 		 418 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0895  secretion protein HlyD family protein  48.55 
 
 		 405 aa  316  6e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5231  HlyD family secretion protein  41.53 
 
 		 426 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  43.46 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2470  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 		 607 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4096  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  31.27 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  26.65 
 
 		 345 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2851  hypothetical protein  23.74 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  30.28 
 
 		 374 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2991  hypothetical protein  23.5 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.67 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  24.41 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.22 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.81 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  23.41 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2222  secretion protein HlyD family protein  28.12 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.827157  normal  0.0630551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  27.89 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03081  ABC transporter ATP-binding protein  22.87 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.955285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  25.56 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  26.17 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2009  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.91 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3793  secretion protein HlyD family protein  27.27 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0039  macrolide-specific efflux protein  24.91 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.461256  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.23 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0080  RND family efflux transporter MFP subunit  29.53 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.95759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1890  secretion protein HlyD family protein  24.9 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  29.83 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.67 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.42 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.66 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0460  multidrug resistance protein  21.61 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.27 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.69 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.43 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.01 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.65 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0097  secretion protein HlyD family protein  26.11 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  25.98 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  22.17 
 
 		 431 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  30.65 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  26.19 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0878  secretion protein HlyD  23.17 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0949246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0253  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.195856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.94 
 
 		 461 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  25.42 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  25.77 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  26.05 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 333 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  25.7 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  23.16 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  25.33 
 
 		 328 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  25.83 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.08 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  23.67 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.77 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  26.89 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  26.24 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2390  secretion protein HlyD family protein  28.77 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.313977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.11 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  24.75 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.09 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  28.62 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.11 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  25.08 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  25.66 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  23.39 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 476 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.74 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1996  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000694745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  28.52 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  26.64 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  27.24 
 
 		 383 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  24.19 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1985  secretion protein HlyD family protein  24.4 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.172504  hitchhiker  0.00138161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  22.37 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  24.4 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1554  MFP family transporter  24.4 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.51 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  25.94 
 
 		 355 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  26.09 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1057  multidrug resistance protein, putative  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0394345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1503  putative multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.45 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0995  putative multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0171  putative multidrug resistance protein  26.69 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.152509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>