More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4457 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 455 aa  862    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8343  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.82 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  42.12 
 
 		 476 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1868  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.57 
 
 		 474 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  31.2 
 
 		 622 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  27.4 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  25.34 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3483  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.08 
 
 		 598 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.807091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  24.14 
 
 		 431 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2220  RND family efflux transporter MFP subunit  25.25 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  24.42 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  33.75 
 
 		 536 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 453 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.36 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.8 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3408  RND family efflux transporter MFP subunit  26.05 
 
 		 389 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  22.2 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  27.13 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.37 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.87 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  23.5 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  20.51 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.77 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  22.95 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  24.45 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  24.89 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.92 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  32.43 
 
 		 540 aa  71.2  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  21.63 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  19.52 
 
 		 521 aa  70.1  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  23.84 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2991  hypothetical protein  22.25 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3323  secretion protein HlyD  23.13 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  26.57 
 
 		 392 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.32 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  25.42 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  35.22 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1672  RND family efflux transporter MFP subunit  22.46 
 
 		 429 aa  68.2  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  32.22 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.52 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  24.41 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1436  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.23 
 
 		 393 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2552  secretion protein HlyD  23.92 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.603084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  24.94 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2851  hypothetical protein  22.38 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.69 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  19.78 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.73 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  23.41 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 376 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 430 aa  67  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  21.41 
 
 		 354 aa  67  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0963  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.67 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0174638  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.09 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  23.01 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.62 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89791  normal  0.261432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  30.23 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  23.02 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.21 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  25.18 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2533  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.66716  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1756  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0637221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  25.06 
 
 		 449 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  22.12 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  23.44 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  24.94 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.02 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.71 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  23.7 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.55 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1983  RND family efflux transporter MFP subunit  29.65 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  18.63 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  32.16 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3050  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.56 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132301  normal  0.0180542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.46 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.48 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.175978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.86 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.11 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2520  RND family efflux transporter MFP subunit  24.61 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.62 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  26.35 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  29.7 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  25.68 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 376 aa  63.2  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>