More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0410 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 476 aa  884    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8343  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 462 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.02 
 
 		 455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1868  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.45 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  26.28 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1515  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0882  hypothetical protein  25.93 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0913  hypothetical protein  30.51 
 
 		 338 aa  80.1  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1621  secretion protein HlyD  26.11 
 
 		 407 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.97 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.58 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.68 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2149  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.49 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.111795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  27.17 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0739  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.16 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.941037  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0431  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.07 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.54 
 
 		 405 aa  73.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 		 377 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  26.34 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  30.73 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.43 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.2 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  35.93 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  23.48 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  36.88 
 
 		 546 aa  70.1  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  27.18 
 
 		 504 aa  70.1  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.98 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.23 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.67 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  30.72 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4025  secretion protein HlyD family protein  26.14 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.52 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.06 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.82 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 365 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0480  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  24.57 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 		 537 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5856  secretion protein HlyD  34.52 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.249167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25.07 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.13 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.27 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.81 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.22 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.3 
 
 		 376 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  32.8 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1676  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.47 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  28.81 
 
 		 622 aa  65.1  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.22 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.21 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.22 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.21 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  24.31 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.21 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.21 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  31.61 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.87 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.22 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  30.63 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  22.79 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  28.3 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  35.87 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  32.04 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  25.29 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2454  RND family efflux transporter MFP subunit  30.64 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3732  secretion protein HlyD family protein  24.79 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  31.07 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  34.38 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 359 aa  63.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.29 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  32.92 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  25.39 
 
 		 411 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.25 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  29.21 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  29.89 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60760  hypothetical protein  27.46 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  23.95 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  35.63 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  32.92 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000249801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0231  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0223  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 396 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 385 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  30.05 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>