More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3274 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  62.04 
 
 		 598 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.85 
 
 		 380 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  36.92 
 
 		 386 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  37.83 
 
 		 393 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  41.33 
 
 		 449 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  35.1 
 
 		 536 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  37.79 
 
 		 622 aa  107  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  37.06 
 
 		 405 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  33.82 
 
 		 370 aa  94.4  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  33.82 
 
 		 370 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  33.82 
 
 		 370 aa  94.4  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  27.82 
 
 		 521 aa  91.3  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  32.02 
 
 		 348 aa  89.4  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1084  MacA  30.54 
 
 		 402 aa  89  5e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.18 
 
 		 429 aa  88.2  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  26.58 
 
 		 394 aa  87.4  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  33.02 
 
 		 408 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1863  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 393 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  33.02 
 
 		 408 aa  87  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 435 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  32.18 
 
 		 372 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  32.18 
 
 		 372 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  32.18 
 
 		 372 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  31.68 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.5 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  33.5 
 
 		 371 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  32.34 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.01 
 
 		 419 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  27.62 
 
 		 406 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 324 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  27.2 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.62 
 
 		 608 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 		 505 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  32.89 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 448 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  27.27 
 
 		 509 aa  79.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  29.58 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  28.91 
 
 		 400 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  28.19 
 
 		 397 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  32.99 
 
 		 472 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  32.52 
 
 		 431 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  30.54 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.41 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  29.28 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  28.27 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.5 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  32.16 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  31.9 
 
 		 415 aa  75.9  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1144  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.79 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000342468  normal  0.524577 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.61 
 
 		 409 aa  75.9  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  32.85 
 
 		 384 aa  75.5  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  31.69 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  32.8 
 
 		 546 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  31.75 
 
 		 504 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  24.77 
 
 		 377 aa  74.7  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  27.59 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  30.04 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  31.38 
 
 		 538 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.98 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  29.19 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  26.24 
 
 		 394 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2316  secretion protein HlyD family protein  31.22 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.98 
 
 		 508 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.09 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.25 
 
 		 517 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 498 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 537 aa  72  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  30.57 
 
 		 473 aa  72  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  29.41 
 
 		 421 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 420 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  28.87 
 
 		 416 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0769  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.9 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.100875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  34.29 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.65 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2438  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.67 
 
 		 586 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0621  RND family efflux transporter MFP subunit  29.52 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000387759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.29 
 
 		 432 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.45 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  33.85 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  28.22 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  28.86 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  30.72 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.94 
 
 		 431 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  31.88 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>