More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0218 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  841    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.244371  normal  0.0126488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8877  Membrane-fusion protein-like protein  40.72 
 
 		 598 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0841399  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3274  putative multidrug efflux system transmembrane protein  41.33 
 
 		 225 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.668414  normal  0.104011 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 386 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  30.61 
 
 		 536 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3271  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.09 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.525557  normal  0.197401 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  34.36 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21240  multidrug resistance efflux pump  23.73 
 
 		 536 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8876  Membrane-fusion protein-like protein  28.19 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.85 
 
 		 608 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  23.09 
 
 		 521 aa  71.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1450  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.125039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  28.5 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  28.84 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1921  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00271277  normal  0.413551 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  28.92 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13031  membrane fusion protein  21.78 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1064  macrolide-specific efflux protein macA  26.51 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0267322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.44 
 
 		 371 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  29.44 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.81 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0694  secretion protein HlyD  29.15 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.459164  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  27.31 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  29.44 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  27.44 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  27.44 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0709  macrolide-specific efflux protein macA  26.05 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  31.28 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  29.44 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  27.78 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  27.57 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1039  macrolide transporter subunit MacA  28.93 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  27.78 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.96 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  28.93 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2146  RND family efflux transporter MFP subunit  30.06 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0449485  normal  0.0115764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.7 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10570  hypothetical protein  26 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0976  macrolide transporter subunit MacA  28.93 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  29.65 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.65 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0322  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 353 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619651 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  25.58 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13281  membrane fusion protein  21.29 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.403546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.98 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  26.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13141  membrane fusion protein  21.29 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.18 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.59 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1965  secretion protein HlyD  26.87 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.455875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  24.71 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  27.7 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  28.43 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.35 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1235  secretion protein HlyD  21.29 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.681968  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.71 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  27.88 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5358  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.45 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2603  secretion protein HlyD  28.99 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.22725  normal  0.133946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  25.94 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  28.8 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.79 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  28.72 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.6 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.48 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5197  hypothetical protein  26.33 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0742487 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  26.72 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.21 
 
 		 430 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0336  secretion protein HlyD  27.53 
 
 		 324 aa  57  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0816826  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3412  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 443 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0866166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.73 
 
 		 509 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  28.97 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  29.67 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.1 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6201  putative accessory protein to ABC-type macrolide transport protein MacB  24.7 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0950  secretion protein HlyD  31.18 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.57805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08701  membrane fusion protein  31.43 
 
 		 392 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3561  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.306068  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  29.13 
 
 		 444 aa  55.8  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.17 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0319  RND family efflux transporter MFP subunit  19.31 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3828  secretion protein HlyD  28.21 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 580 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.491967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  29.95 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 546 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  24.88 
 
 		 517 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>