More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2761 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 607 aa  1236    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2921  60 kDa inner membrane insertion protein  39.69 
 
 		 583 aa  398  1e-109  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000870087  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2335  60 kDa inner membrane insertion protein  39.24 
 
 		 584 aa  397  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.30148 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  40.07 
 
 		 587 aa  392  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2129  Oxa1/60 kDa IMP family protein  38.96 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00488382  normal  0.707448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2521  60 kDa inner membrane insertion protein  38.92 
 
 		 583 aa  385  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.39836  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  38.97 
 
 		 584 aa  382  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2740  protein translocase subunit yidC  38.55 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6611  60 kDa inner membrane insertion protein  30.05 
 
 		 617 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290121  normal  0.0199221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2014  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  29.26 
 
 		 621 aa  259  8e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.121616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08476  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.21 
 
 		 622 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0158  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.26 
 
 		 621 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.413762  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2384  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.76 
 
 		 636 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1150  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.28 
 
 		 602 aa  221  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333218  decreased coverage  0.00602156 
 
 
-
 
NC_002950  PG0526  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 		 627 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.710508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  32.27 
 
 		 559 aa  211  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2587  60 kDa inner membrane insertion protein  27.15 
 
 		 600 aa  210  7e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0340574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2597  60 kDa inner membrane insertion protein  30.91 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  28.6 
 
 		 542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2600  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  30.72 
 
 		 567 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.417089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.21 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.94 
 
 		 553 aa  193  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.33 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 		 554 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.91 
 
 		 554 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  27.86 
 
 		 556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.97 
 
 		 541 aa  191  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.3 
 
 		 555 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.62 
 
 		 552 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.62 
 
 		 552 aa  190  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.28 
 
 		 541 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.82 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.62 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.76 
 
 		 550 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  29.11 
 
 		 552 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.33 
 
 		 553 aa  187  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.76 
 
 		 554 aa  187  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  30.72 
 
 		 550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  27.34 
 
 		 536 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.12 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.44 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4514  YidC translocase/secretase  31.54 
 
 		 546 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.04 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.38 
 
 		 558 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.38 
 
 		 548 aa  184  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4385  60 kDa inner membrane insertion protein  29.52 
 
 		 559 aa  183  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234218 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2122  inner membrane protein oxaA  27.31 
 
 		 566 aa  183  7e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3561  protein translocase subunit yidC  29.71 
 
 		 536 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.02 
 
 		 543 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4002  60 kDa inner membrane insertion protein  28.13 
 
 		 541 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000355464  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0201  60 kDa inner membrane protein  27.5 
 
 		 566 aa  183  9.000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2776  60 kDa inner membrane insertion protein  27.5 
 
 		 569 aa  182  1e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395944  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.32 
 
 		 628 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  29.17 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4506  60 kDa inner membrane insertion protein  29.57 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.417541  normal  0.699877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  28.35 
 
 		 540 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.37 
 
 		 557 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4358  protein translocase subunit yidC  31.32 
 
 		 545 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.85 
 
 		 560 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.43 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  28.59 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 		 560 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4495  60 kDa inner membrane insertion protein  31.06 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2557  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.84 
 
 		 620 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0157093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.43 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.66 
 
 		 560 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.97 
 
 		 555 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.92 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  26.22 
 
 		 542 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.46 
 
 		 543 aa  179  9e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.92 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1472  60 kDa inner membrane insertion protein  30.42 
 
 		 604 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.577642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 		 548 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0032  inner membrane protein, 60 kDa  28.57 
 
 		 528 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  26.5 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4312  60 kDa inner membrane insertion protein  27.86 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.301696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0033  60 kDa inner membrane insertion protein  28.57 
 
 		 528 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.401707 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.98 
 
 		 623 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.98 
 
 		 623 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4257  60 kDa inner membrane insertion protein  26.79 
 
 		 545 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000606394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.36 
 
 		 543 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  27.12 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4521  60 kDa inner membrane insertion protein  28.85 
 
 		 541 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305334  hitchhiker  0.000938862 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.78 
 
 		 532 aa  177  7e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4380  60 kDa inner membrane insertion protein  28.65 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000064378  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4379  60 kDa inner membrane insertion protein  28.65 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000322788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4325  YidC translocase/secretase  28.65 
 
 		 541 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000679014  unclonable  0.00000000000486692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  29.4 
 
 		 604 aa  176  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  27.81 
 
 		 550 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>