More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2200 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 203 aa  400  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  23.28 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  20.71 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  23.94 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 288 aa  58.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  31.25 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  22.11 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  25.52 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 600 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>