More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2069 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 839 aa  1684    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  40.55 
 
 		 894 aa  588  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  37.6 
 
 		 831 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  39.39 
 
 		 915 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  38.92 
 
 		 914 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  37.38 
 
 		 823 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.76 
 
 		 870 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  35.6 
 
 		 866 aa  460  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  35.81 
 
 		 857 aa  458  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  33.41 
 
 		 887 aa  449  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  38.17 
 
 		 836 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 		 814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  33.53 
 
 		 832 aa  446  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 		 820 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  37.24 
 
 		 897 aa  438  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  37.44 
 
 		 927 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  35.38 
 
 		 845 aa  417  9.999999999999999e-116  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.2 
 
 		 813 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  33.01 
 
 		 833 aa  402  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  34.91 
 
 		 850 aa  399  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4044  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.91 
 
 		 874 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.05 
 
 		 838 aa  389  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  37.69 
 
 		 832 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  32.68 
 
 		 913 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  32.39 
 
 		 897 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  32.67 
 
 		 839 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  33.33 
 
 		 852 aa  376  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  31.46 
 
 		 851 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  30.69 
 
 		 913 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  30.92 
 
 		 913 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  32.3 
 
 		 884 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  31.94 
 
 		 843 aa  372  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  30.92 
 
 		 906 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  31.06 
 
 		 843 aa  357  3.9999999999999996e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2625  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  34.49 
 
 		 820 aa  354  4e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.5 
 
 		 904 aa  340  5.9999999999999996e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  33.99 
 
 		 816 aa  340  7e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  32.18 
 
 		 772 aa  336  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.24 
 
 		 966 aa  331  4e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  31.99 
 
 		 738 aa  326  9e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  32.33 
 
 		 881 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  31.87 
 
 		 738 aa  324  4e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.42 
 
 		 757 aa  313  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  32.87 
 
 		 882 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  32.99 
 
 		 882 aa  308  4.0000000000000004e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  33.22 
 
 		 898 aa  298  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.82 
 
 		 746 aa  298  4e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.37 
 
 		 889 aa  292  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  41.87 
 
 		 745 aa  285  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 749 aa  282  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40 
 
 		 758 aa  281  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.45 
 
 		 711 aa  281  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  44.7 
 
 		 693 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.7 
 
 		 933 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.63 
 
 		 755 aa  273  7e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.16 
 
 		 886 aa  273  8.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.46 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  27.14 
 
 		 875 aa  267  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 		 734 aa  266  8.999999999999999e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  39.13 
 
 		 762 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.28 
 
 		 1072 aa  263  6.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  40.75 
 
 		 730 aa  260  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.94 
 
 		 927 aa  260  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  40.25 
 
 		 721 aa  259  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  40.25 
 
 		 722 aa  259  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.88 
 
 		 755 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  41.46 
 
 		 750 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  38.29 
 
 		 717 aa  256  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  36.32 
 
 		 731 aa  256  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.03 
 
 		 818 aa  255  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  28.65 
 
 		 893 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  40.31 
 
 		 747 aa  255  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.74 
 
 		 751 aa  254  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  37.32 
 
 		 721 aa  253  9.000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  37.97 
 
 		 738 aa  251  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  40.69 
 
 		 760 aa  251  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  40.32 
 
 		 731 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  40.38 
 
 		 733 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.36 
 
 		 790 aa  247  6.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  40.38 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.09 
 
 		 750 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  40.38 
 
 		 733 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.24 
 
 		 748 aa  246  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  39.29 
 
 		 735 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  41.71 
 
 		 777 aa  244  6e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  39.73 
 
 		 549 aa  244  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  39.73 
 
 		 731 aa  244  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  39.57 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  39.57 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  39.57 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  41.96 
 
 		 740 aa  243  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  39.73 
 
 		 922 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.92 
 
 		 813 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  39.58 
 
 		 733 aa  241  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  39.76 
 
 		 987 aa  241  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.19 
 
 		 724 aa  241  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  36.67 
 
 		 800 aa  240  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.72 
 
 		 737 aa  238  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  38.24 
 
 		 748 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  37.4 
 
 		 895 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>