More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4939 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4939  ROK family protein  100 
 
 		 419 aa  851    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  48.45 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.46 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.87 
 
 		 396 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.75 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.61 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.75 
 
 		 408 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.61 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  25.65 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.9 
 
 		 383 aa  120  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  27.88 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.81 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  24.68 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.56 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.42 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.26 
 
 		 400 aa  113  6e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2703  ROK family protein  24.01 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2703  ROK family protein  24.01 
 
 		 397 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02442  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.01 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1118  ROK familiy protein  24.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.869642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3783  ROK family protein  24.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02406  hypothetical protein  24.01 
 
 		 397 aa  112  8.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2835  ROK family protein  24.01 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1127  ROK family protein  24.01 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  27.34 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  27.07 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  29.35 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  25.88 
 
 		 418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.96 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  26.93 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  22.54 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  27.27 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  28.57 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  26.62 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.33 
 
 		 410 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  28.43 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  31.95 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.21 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  28.85 
 
 		 390 aa  106  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  26.4 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.52 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  29.66 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.25 
 
 		 425 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.25 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  30.4 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  28.85 
 
 		 395 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  27.25 
 
 		 425 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.87 
 
 		 407 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1680  ROK family protein  28.21 
 
 		 376 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  27.94 
 
 		 425 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  33.59 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  25.79 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.75 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  27.27 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  28.07 
 
 		 347 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  24.81 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  25.61 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  26.17 
 
 		 400 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  27.62 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.84 
 
 		 405 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  24.61 
 
 		 409 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0993  glucokinase  34.55 
 
 		 302 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.04 
 
 		 390 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  27.25 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  26.71 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  26.71 
 
 		 315 aa  100  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4232  ROK family protein  25.21 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.492829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  27.6 
 
 		 410 aa  99.8  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.03 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  25.92 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0965  glucokinase  34.55 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.633667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0983  glucokinase  34.55 
 
 		 302 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157421  normal  0.169764 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0233  ROK family protein  28.67 
 
 		 385 aa  99.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1594  ROK family protein  28.81 
 
 		 754 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  26.29 
 
 		 395 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  24.35 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  20.86 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  28.35 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  24.87 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  26.62 
 
 		 407 aa  97.8  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  24.35 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  28.74 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  27.45 
 
 		 503 aa  97.4  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1092  ROK family protein  30.15 
 
 		 402 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  28.85 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.57 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  23.25 
 
 		 381 aa  97.1  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  25.92 
 
 		 397 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  24.16 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  28.93 
 
 		 401 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  23.35 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  29.82 
 
 		 313 aa  95.9  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  22.62 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  25.4 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.75 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4825  ROK family protein  27.3 
 
 		 417 aa  93.6  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  30.04 
 
 		 307 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  23.08 
 
 		 385 aa  93.6  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3774  ROK family protein  26.58 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.334489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>